Análises do genoma, transcriptoma, construção de mutantes e caracterização fenotípica de linhagens de Campylobacter coli isoladas de diversas fontes durante 25 anos no Brasil

Resumo

A infecção causada por Campylobacter spp. é uma zoonose de distribuição mundial com repercussões significativas no nível da saúde pública. Entretanto, no Brasil o estudo e o isolamento de C. coli não são muito frequentes o que dificulta avaliar o seu envolvimento como causador de doenças em seres humanos e animais, assim como, determinar o impacto da sua presença nos alimentos e no ambiente. Esse projeto tem como objetivos analisar, pelos dados do sequenciamento do genoma, transcriptoma, construção de mutantes e testes fenotípicos relacionados à virulência, resistência e sobrevivência a diferentes condições de estresse, 82 linhagens de C. coli isoladas de humanos, animais, ambiente e alimentos entre 1995-2019 no Brasil. Para todas as linhagens serão realizadas análises comparativas dos genomas por wgMLST, ANI, pan-genoma e sequencias CRISPR, bem como será verificada a presença de genes relacionados a virulência, ilhas de patogenicidade, sequências de profagos, plasmídeos, ilhas metabólicas e genes tlp, relacionados com a quimiotaxia, formação de biofilme, interação com células intestinais humanas e colonização em aves. Os testes fenotípicos de motilidade, formação de biofilme, aerotolerância, resistência ao congelamento, aquecimento e ao ácido peracético serão realizados para 40 linhagens. A virulência em Galleria mellonella será verificada para 20 linhagens. A análise do transcriptoma de uma linhagem de C. coli submetida ao modelo colônico in vitro SEMH®, bem como a avaliação da modulação da microbiota intestinal nesse modelo serão realizadas. Após a identificação dos tlp presentes, a construção de mutantes pela deleção de um ou mais tlp de escolha e a análise do fenótipo da(s) estirpe(s) mutante(s) serão realizados. Devido à escassez de estudos envolvendo a espécie de C. coli, estudos que objetivem análises do genoma, dos mecanismos de patogenicidade, virulência e sobrevivência a diferentes condições de estresse são originais e de grande importância. Os resultados a serem obtidos deverão contribuir expressivamente para a caracterização de C. coli isolados durante 25 anos no Brasil. (AU)