Análises do genoma, construção de mutantes e caracterização fenotípica de linhagens de Campylobacter coli isoladas de diversas fontes durante 16 anos no Brasil

Resumo

A infecção causada por Campylobacter spp. é uma zoonose de distribuição mundial com repercussões significativas no nível da Saúde Pública e com elevado impacto socioeconômico. No entanto, no Brasil o estudo e o isolamento de C. coli não são muito frequentes o que dificulta avaliar o impacto da presença desse patógeno no país. Esse projeto tem como objetivos analisar, através do genoma completo, construção de mutantes e testes fenotípicos relacionados à virulência, resistência e sobrevivência a diferentes condições de estresse, 63 linhagens de C. coli isoladas de humanos, animais, ambiente e alimentos entre 1995-2011 no Brasil. A análise comparativa do genoma completo por wgMLST, ANI, pan-genoma e sistema CRISPR será realizada para todas as linhagens de C. coli do presente estudo. A presença de genes relacionados a virulência e ilhas de patogenicidade, sequencias de profagos, presença de plasmídeos, ilhas metabólicas e a presença de genes tlp dos grupos A, B e C, relacionados com a quimiotaxia, formação de biofilme, interação com células intestinais humanas e colonização em aves, também serão analisados. Os testes fenotípicos de motilidade, formação de biofilme, aerotolerância, resistência ao congelamento, aquecimento, e ao ácido peracético, além de virulência em Galleria mellonella serão realizados para todas as linhagens do presente estudo. Após a identificação dos tlp presentes, a construção de mutantes pela deleção de um ou mais tlp de escolha e a análise do fenótipo das estirpes mutantes serão realizados. Devido à escassez de estudos envolvendo a espécie de C. coli, estudos que objetivem a elucidação dos mecanismos de patogenicidade, virulência e sobrevivência a diferentes condições de estresse são inéditos e de grande importância. Os resultados a serem obtidos deverão contribuir expressivamente para a caracterização de C. coli isolados durante 16 anos no Brasil, colaborando para um melhor entendimento desse patógeno considerado de grande importância mundial.