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Análises genômicas para associação de SNPs com resistência a Aeromonas hydrophila e rendimento de filé no tambaqui (Colossoma macropomum)

Processo: 17/19717-3
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de abril de 2018
Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2021
Área de conhecimento:Ciências Agrárias - Recursos Pesqueiros e Engenharia de Pesca - Aquicultura
Pesquisador responsável:Diogo Teruo Hashimoto
Beneficiário:Raquel Belini Ariede
Instituição Sede: Centro de Aquicultura (CAUNESP). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):19/10662-7 - Estudo de associação genômica ampla para resistência a Aeromonas hydrophila em tambaqui (Colossoma macropomum), BE.EP.DR
Assunto(s):Peixes   Resistência à doença   Locos de características quantitativas
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Disease resistance | Fish | growth performance | Qtl | selective breeding | Produção de peixes

Resumo

O tambaqui (Colossoma macropomum), natural das bacias do rio Amazonas e do rio Orinoco, possui características zootécnicas favoráveis ao sistema de cultivo e boa aceitação de mercado, sendo o principal peixe nativo produzido pela aquicultura nacional. Contudo, há poucos estudos genéticos realizados com esta espécie, especialmente de melhoramento genético e associação genômica com características de interesse produtivo. O objetivo deste trabalho é caracterizar o desempenho zootécnico de famílias de tambaqui C. macropomum para resistência a Aeromonas hydrophila e características de crescimento, por meio de genética quantitativa e associação genômica de SNPs (single nucleotide polymorphisms). Os parâmetros de genética quantitativa serão avaliados em 15 famílias de tambaqui (previamente estabelecidas no Caunesp), para características de resistência a A. hydrophila e crescimento (peso, quatro características morfométricas e rendimento de filé). Em relação à caracterização de QTL (quantitative trait loci) para resistência a A. hydrophila e rendimento de filé, será realizado o mapeamento de SNPs por ddRAD-seq (double digest restriction site associated DNA sequencing) em 10 famílias de tambaqui. Espera-se que estas tecnologias genéticas possam indicar novas perspectivas para a produção aquícola nacional. Além disso, as informações geradas por este projeto, aliadas a estudos de desempenho zootécnico, permitirão acelerar e maximizar a produção do principal grupo de peixes nativos, auxiliando na demanda e produção de melhor qualidade.

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Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ARIEDE, RAQUEL B.; FREITAS, MILENA, V; LIRA, LIESCHEN V. G.; AGUDELO, JOHN F. G.; BORGES, CAROLINA H. S.; MASTROCHIRICO-FILHO, VITO A.; CACERES, PABLO; YANEZ, JOSE M.; HASHIMOTO, DIOGO T.. Linkage map for chromosome-level genome anchoring and genome-wide association study for resistance to Aeromonas hydrophila in Colossoma macropomum. Aquaculture, v. 560, p. 11-pg., . (17/19717-3, 19/10662-7, 18/08416-5)
ARIEDE, RAQUEL B.; FREITAS, V, MILENA; AGUDELO, JOHN F. G.; BORGES, CAROLINA H. S.; LIRA, LIESCHEN V. G.; YOSHIDA, GRAZYELLA M.; PILARSKI, FABIANA; YANEZ, JOSE M.; HASHIMOTO, DIOGO T.. Genetic (co)variation between resistance to Aeromonas hydrophila and growth in tambaqui (Colossoma macropomum). Aquaculture, v. 523, . (18/08416-5, 17/19717-3, 19/10662-7)
MASTROCHIRICO-FILHO, VITO A.; ARIEDE, RAQUEL B.; FREITAS, V, MILENA; BORGES, CAROLINA H. S.; LIRA, LIESCHEN V. G.; MENDES, NATALIA J.; AGUDELO, JOHN F. G.; CACERES, PABLO; BERROCAL, MILTHON H. M.; SUCERQUIA, GUSTAVO A. L.; et al. Development of a multi-species SNP array for serrasalmid fish Colossoma macropomum and Piaractus mesopotamicus. SCIENTIFIC REPORTS, v. 11, n. 1, . (16/21011-9, 17/26900-9, 20/11049-4, 16/18294-9, 18/08416-5, 17/19717-3, 19/10662-7, 19/08972-8)
ARIEDE, RAQUEL B.; LEMOS, CELMA G.; BATISTA, FABRICIO M.; OLIVEIRA, RUBENS R.; AGUDELO, JOHN F. G.; BORGES, CAROLINA H. S.; IOPE, ROGERIO L.; ALMEIDA, FERNANDA L. O.; BREGA, JOSE R. F.; HASHIMOTO, DIOGO T.. Computer vision system using deep learning to predict rib and loin yield in the fish Colossoma macropomum. ANIMAL GENETICS, v. 54, n. 3, p. 14-pg., . (17/19717-3, 18/08416-5, 19/10662-7)
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
ARIEDE, Raquel Belini. Análises genômicas para associação de SNPs com resistência à Aeromonas hydrophila e rendimento de filé no tambaqui (Colossoma macropomum). 2021. Tese de Doutorado - Universidade Estadual Paulista (Unesp). Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias. Jaboticabal Jaboticabal.