Desenvolvimento e integração de ferramentas computacionais para a análise de transcriptoma de espécies de Piper

Resumo

Piper é um gênero de distribuição Pantropical com importância econômica e ecológica dentro da família Piperaceae. Durante ontogenia de espécies de Piper foi observado grande variabilidade química, por exemplo, a variação de apiol e dilapiol entre plântulas e folhas de indivíduos adultos de Piper gaudichaudianum. Além disso, foi verificada a presença de neolignanas di-hidrobenzofurânicas e lignanas tetraidrofurânicas em folhas de indivíduos P. regnellii e P. solmsianum. Tais compostos em plântulas podem estar envolvidos em interações plantas-inseto-parasitoide, entretanto ainda há grande lacuna no entendimento da diversidade de interações tróficas mediadas quimicamente. Uma das propostas do projeto temático é a descrição dos fenômenos envolvidos na ontogenia através da análise química bem como do estudo do transcriptoma para algumas espécies de Piper. Assim, pretende caracterizar os genes e as vias metabólicas diferencialmente envolvidos no processo de ontogenia através de RNA-seq. Nesta técnica um imenso volume de dados são gerados e a prospecção dos transcritos requer ferramentas computacionais robustas, de alta performance e que preferencialmente sejam processadas em paralelo. A análise estatística coerente dos dados e a eficiência dos algoritmos desenvolvidos para execução dessas análises são críticos para a interpretação apropriada. Será desenvolvido um banco de dados local para armazenar os resultados a serem utilizados em estudos posteriores. (AU)