Compreendendo o papel das interações patógeno-hospedeiro e o impacto do sistema de gestão para o desenvolvimento de resistência antimicrobiana em sistemas de pecuária brasileira

Resumo

A hipótese deste projeto é verificar se existem diferenças associadas com o sistema de produção e zona agroecológica em termos de prevalência de AMR. Intervenções de manejo e dietéticas (como taninos) podem alterar o microbioma do animal hospedeiro e o nível de AMR. Para testar isso, é proposto coleta de amostra de fezes de bovinos de corte de diferentes idades de dois diferentes sistemas e zonas agroecológicas. As amostras fecais serão analisadas para metagenômica funcional de AMR (no CENA), composição do microbioma por 168 RNA (na UoR) e cultivo fecal para determinar a AMR fenotipicamente (no CENA). Amostras de forragem seriam tomadas para análise da composição química e compostos bioativos/metabolitos secundária de planta por NMR (na UoR). A partir desses dados, determinaremos quais zonas agroecológica sistemas podem estar associados com alta ou baixa prevalência de AMR. Na segunda fase, de forma mais controlada, pretendemos alterar o microbioma dos animais com elevado AMR visando aqueles dos animais com baixo AMR. Neste ponto, também investigaremos a AMR associados ao microbioma do solo em diferentes regiões. (AU)