| Processo: | 20/00740-8 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Mestrado |
| Data de Início da vigência: | 01 de novembro de 2020 |
| Data de Término da vigência: | 31 de outubro de 2022 |
| Área de conhecimento: | Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Teoria da Computação |
| Pesquisador responsável: | João Meidanis |
| Beneficiário: | Lucas Peres Oliveira |
| Instituição Sede: | Instituto de Computação (IC). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil |
| Assunto(s): | Biologia computacional Genomas Rearranjo gênico Análise de sequência de DNA Filogenia |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Comparação de genomas | Distância de Posto | enumeração | Rearranjo de Genomas | Bioinformática |
Resumo Os avanços nas tecnologias de sequenciamento de DNA permitiram a fácil aquisição de genomas em ambientes computacionais. Métodos para reconstruir filogenias baseados em eventos de rearranjo dependem de uma noção de distância entre genomas que faça sentido biologicamente e que possa ser computada de forma eficiente. Vários modelos e métricas de distância foram desenvolvidos ao longo dos anos para atingir esses objetivos, dentre os quais a modelagem por matrizes e a distância de posto abriram uma nova perspectiva para o problema. Neste trabalho, pretendemos consolidar os avanços recentes da extensão desse modelo para genomas com indels e a contagem de cenários de ordenação que ocorrem entre dois genomas. Além disso, almejamos iniciar o estudo de uma extensão para a distância de posto que acomode genomas com segmentos repetidos. (AU) | |
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