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Deep learning e representações intermediárias para análise de imagens pediátricas

Processo: 20/06744-5
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2020
Data de Término da vigência: 31 de maio de 2023
Área de conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Sistemas de Computação
Pesquisador responsável:Roberto Marcondes Cesar Junior
Beneficiário:Hugo Neves de Oliveira
Instituição Sede: Instituto de Matemática e Estatística (IME). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:15/22308-2 - Representações intermediárias em Ciência Computacional para descoberta de conhecimento, AP.TEM
Assunto(s):Diagnóstico por imagem   Análise de imagens   Aprendizagem profunda   Pediatria   Ressonância magnética   Grafos   Análise espaço-temporal   Processamento de imagens
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Aprendizado profundo | Imagens Médicas | Processamento de imagens | Radiologia Pediátrica | Reconhecimento de Padrões | Ressonância Magnética | Imagens Médicas

Resumo

As imagens médicas requerem o desenvolvimento de métodos para melhorar a precisão nos resultados da análise de imagens. Os avanços na análise de imagens médicas fornecem tais ferramentas, mas ainda há uma lacuna importante em relação à imagem cerebral pediátrica, embora haja uma demanda médica crescente. Este projeto visa contribuir para preencher essa lacuna, com foco na Ressonância Magnética cerebral (RM) de bebês, recém-nascidos e bebês prematuros, que levantam questões específicas devido ao contraste particular de matéria cinzenta/branca relacionada ao processo de mielinização fisiológica, à evolução muito rápida, mas não continuamente observada das estruturas cerebrais e possíveis patologias, bem como à alta variabilidade intra e inter-sujeita. Uma dessas questões é que os dados são tipicamente ruidosos, ambíguos, escassos e esparsos no tempo. Por sua vez, o conhecimento médico especializado está disponível, mas é propenso a mudanças e evolução. Deste ponto de vista, o projeto aborda uma das questões de ponta na análise de dados, ou seja, como extrair e entender padrões significativos onde os dados são escassos, mas o conhecimento especializado, continuamente enriquecido, está disponível. Propomos desenvolver representações estruturais de conhecimento e informações de imagens na forma de grafos e hipergrafos, que serão exploradas para orientar a compreensão de imagens espaço-temporais (segmentação, reconhecimento, quantificação, comparação ao longo do tempo, descrição do conteúdo de imagem e evolução). Tais técnicas serão complementadas por abordagens de deep learning para processamento das imagens 2D ou 3D. O objetivo do projeto é desenvolver métodos computacionais para apoiar o diagnóstico, análise patológica e acompanhamento dos pacientes. (AU)

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Publicações científicas (13)
(As publicações científicas contidas nesta página são originárias da Web of Science ou da SciELO, cujos autores mencionaram números dos processos FAPESP concedidos a Pesquisadores Responsáveis e Beneficiários, sejam ou não autores das publicações. Sua coleta é automática e realizada diretamente naquelas bases bibliométricas)
OLIVEIRA, HUGO; CESAR, ROBERTO M., JR.; GAMA, PEDRO H. T.; DOS SANTOS, JEFERSSON A.; DECARVALHO, BM; GONCALVES, LMG. . 2022 35TH SIBGRAPI CONFERENCE ON GRAPHICS, PATTERNS AND IMAGES (SIBGRAPI 2022), v. N/A, p. 6-pg., . (20/06744-5, 15/22308-2)
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NUNES, IAN; PEREIRA, MATHEUS B.; OLIVEIRA, HUGO; DOS SANTOS, JEFERSSON A.; POGGI, MARCUS; IEEE. . 2022 IEEE INTERNATIONAL CONFERENCE ON IMAGE PROCESSING, ICIP, v. N/A, p. 5-pg., . (20/06744-5, 15/22308-2)
OLIVEIRA, HUGO; PENTEADO, LARISSA; MACIEL, JOSE LUIZ; FERRACIOLLI, SUELY FAZIO; TAKAHASHI, MARCELO STRAUS; BLOCH, ISABELLE; CESAR JUNIOR, ROBERTO; IEEE COMP SOC. . 2021 34TH SIBGRAPI CONFERENCE ON GRAPHICS, PATTERNS AND IMAGES (SIBGRAPI 2021), v. N/A, p. 8-pg., . (19/16112-9, 15/22308-2, 18/07386-5, 20/06744-5, 17/50236-1)
NUNES, IAN M.; POGGI, MARCUS; OLIVEIRA, HUGO; PEREIRA, MATHEUS B.; DOS SANTOS, JEFERSSON A.; DECARVALHO, BM; GONCALVES, LMG. . 2022 35TH SIBGRAPI CONFERENCE ON GRAPHICS, PATTERNS AND IMAGES (SIBGRAPI 2022), v. N/A, p. 6-pg., . (20/06744-5, 15/22308-2)
MONTEIRO, BRUNO A. A.; OLIVEIRA, HUGO; DOS SANTOS, JEFERSSON A.. . IEEE Geoscience and Remote Sensing Letters, v. 19, p. 5-pg., . (20/06744-5, 15/22308-2)
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DA SILVA, MATEUS PINTO; SCHAEFER, MARIANA A. R.; OLIVEIRA, HUGO N.; REIS, JULIO C. S.; NUNES, IAN M.; DOS SANTOS, JEFERSSON A.. . 2024 37TH SIBGRAPI CONFERENCE ON GRAPHICS, PATTERNS AND IMAGES, SIBGRAPI 2024, v. N/A, p. 6-pg., . (15/22308-2, 20/06744-5, 17/50236-1)
CHAMORRO MARTINEZ, JORGE A.; OLIVEIRA, HUGO; DOS SANTOS, JEFERSSON A.; FEITOSA, RAUL QUEIROZ. . IEEE Geoscience and Remote Sensing Letters, v. 19, . (17/50236-1, 20/06744-5, 15/22308-2)
NUNES, IAN; LARANJEIRA, CAMILA; OLIVEIRA, HUGO; DOS SANTOS, JEFERSSON A.. . COMPUTERS & GRAPHICS-UK, v. 115, p. 13-pg., . (15/22308-2, 17/50236-1, 20/06744-5)
BADAIN, RAFAEL; DAMINELI, DANIEL S. C.; PORTES, MARIA TERESA; FEIJO, JOSE; BURATTI, STEFANO; TORTORA, GIORGIA; DE OLIVEIRA, HUGO NEVES; CESAR, ROBERTO M., JR.. . JOVE-JOURNAL OF VISUALIZED EXPERIMENTS, v. N/A, n. 196, p. 15-pg., . (21/05363-0, 20/06744-5, 19/23343-7, 19/26129-6, 15/22308-2)
OLIVEIRA, HUGO; GAMA, PEDRO H. T.; BLOCH, ISABELLE; CESAR JR, ROBERTO MARCONDES. . PATTERN RECOGNITION, v. 153, p. 13-pg., . (20/06744-5, 15/22308-2, 22/15304-4, 17/50236-1)