Bolsa 19/23343-7 - Biologia computacional, Biologia de sistemas

Processo:	19/23343-7
Modalidade de apoio:	Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência:	01 de dezembro de 2019
Data de Término da vigência:	31 de janeiro de 2023
Área de conhecimento:	Interdisciplinar

Pesquisador responsável:	Roberto Marcondes Cesar Junior
Beneficiário:	Daniel Santa Cruz Damineli

Instituição Sede:	Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil

Vinculado ao auxílio:	15/22308-2 - Representações intermediárias em Ciência Computacional para descoberta de conhecimento, AP.TEM


Assunto(s):	Biologia computacional Biologia de sistemas Análise de séries temporais Expressão gênica
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:	intermediate network representations \| systems biology \| Time series analysis \| Biologia Computacional
Resumo O Laboratório de Genômica Pediátrica do Departamento de Pediatria da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP) oferece uma posição de pós-doutorado para cientistas interessados na análise temporal da expressão gênica. O foco do projeto é na análise de séries temporais de expressão gênica para melhor compreender as propriedades dinâmicas dos sistemas biológicos, particularmente nos processos de transição saúde-doença. Especificamente, o bolsista participará de dois projetos: i) desenvolvimento de modelos matemático-computacionais para a investigação das alterações da expressão gênica no hipocampo de ratos submetidos a insulto hipertérmico (modelo animal de Epilepsia induzida por insulto febril); ii) estudo temporal das alterações da expressão gênica em enterócitos humanos durante a interação in vitro com bactérias enteropatogênicas. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa:
Mais itens Menos itens
TITULO

Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias ( ):
Mais itens Menos itens
VEICULO: TITULO (DATA)
VEICULO: TITULO (DATA)

Publicações científicas (8)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

LOURENCO, JOSE; BARROS, SILVIA C.; ZE-ZE, LIBIA; DAMINELI, DANIEL S. C.; GIOVANETTI, MARTA; OSORIO, HUGO C.; AMARO, FATIMA; HENRIQUES, ANA M.; RAMOS, FERNANDA; LUIS, TIAGO; et al. est Nile virus transmission potential in Portuga. COMMUNICATIONS BIOLOGY, v. 5, n. 1, JAN 10 2022. (15/22308-2, 19/23343-7, 20/06160-3)

LI, KUNKUN; PRADA, JUAN; DAMINELI, DANIEL S. C.; LIESE, ANJA; ROMEIS, TINA; DANDEKAR, THOMAS; FEIJO, JOSE A.; HEDRICH, RAINER; KONRAD, KAI ROBERT. An optimized genetically encoded dual reporter for simultaneous ratio imaging of Ca2+ and H+ reveals new insights into ion signaling in plants. NEW PHYTOLOGIST, v. 230, n. 6, FEB 2021. (19/23343-7)

DAMINELI, DANIEL S. C.; PORTES, MARIA TERESA; FEIJO, JOSE A.. Electrifying rhythms in plant cells. CURRENT OPINION IN CELL BIOLOGY, v. 77, p. 11-pg., 2022-07-06. (19/23343-7, 21/05363-0, 19/26129-6, 15/22308-2)

PORTES, MARIA TERESA; DAMINELI, DANIEL S. C.; FEIJO, JOSE A.. Spatiotemporal Quantification of Cytosolic pH in Arabidopsis Pollen Tubes. BIO-PROTOCOL, v. 11, n. 14, JUL 20 2021. (19/26129-6, 19/23343-7, 15/22308-2, 21/05363-0)

PINOTTI, FRANCESCO; WIKRAMARATNA, PAUL S.; OBOLSKI, URI; PATON, ROBERT S.; DAMINELI, DANIEL S. C.; ALCANTARA, LUIZ C. J.; GIOVANETTI, MARTA; GUPTA, SUNETRA; LOURENCO, JOSE. Potential impact of individual exposure histories to endemic human coronaviruses on age-dependent severity of COVID-19. BMC MEDICINE, v. 19, n. 1, JAN 12 2021. (19/23343-7, 20/06160-3)

HOFFMANN, ROBERT D.; PORTES, MARIA TERESA; OLSEN, LENE IRENE; DAMINELI, DANIEL SANTA CRUZ; HAYASHI, MAKI; NUNES, CUSTODIO O.; PEDERSEN, JESPER T.; LIMA, PEDRO T.; CAMPOS, CLAUDIA; FEIJO, JOSE A.; et al. Plasma membrane H+-ATPases sustain pollen tube growth and fertilization. NATURE COMMUNICATIONS, v. 11, n. 1, MAY 14 2020. (19/23343-7)

BADAIN, RAFAEL; DAMINELI, DANIEL S. C.; PORTES, MARIA TERESA; FEIJO, JOSE; BURATTI, STEFANO; TORTORA, GIORGIA; DE OLIVEIRA, HUGO NEVES; CESAR, ROBERTO M., JR.. AMEBaS: Automatic Midline Extraction and Background Subtraction of Ratiometric Fluorescence Time-Lapses of Polarized Single Cells. JOVE-JOURNAL OF VISUALIZED EXPERIMENTS, v. N/A, n. 196, p. 15-pg., 2023-06-01. (21/05363-0, 20/06744-5, 19/23343-7, 19/26129-6, 15/22308-2)

BANDO, SILVIA Y.; BERTONHA, FERNANDA B.; VIEIRA, SANDRA E.; DE OLIVEIRA, DANIELLE B. L.; CHALUP, VANESSA N.; DURIGON, EDISON L.; PALMEIRA, PATRICIA; CURI, ANA CRISTINA P.; FARIA, CAROLINE S.; ANTONANGELO, LEILA; et al. Blood leukocyte transcriptional modules and differentially expressed genes associated with disease severity and age in COVID-19 patients. SCIENTIFIC REPORTS, v. 13, n. 1, p. 17-pg., 2023-01-17. (20/06160-3, 19/23343-7, 15/22308-2)

URL curto