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Variabilidade genômica de nativos americanos e sua possível influência na resposta à patógenos

Processo: 20/10136-0
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2020
Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2022
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
Pesquisador responsável:Tábita Hünemeier
Beneficiário:Renan Barbosa Lemes
Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:20/05326-5 - Aspectos genômicos e epidemiológicos COVID-19 nas populações nativas brasileiras, AP.R
Assunto(s):Genômica   Pandemias   Infecções por Coronavirus   SARS-CoV-2   COVID-19   Comorbidade   Predisposição genética para doença   Genomas   Espírito Santo
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Covid-19 | Genomics | Native Americans | Genômica Médica Populacional

Resumo

O presente projeto visa o sequenciamento de 40 genomas completos de indivíduos infectados pelo SARS-CoV-2 oriundos de duas populações nativo americanas do Espírito Santo (Brasil), a fim de desvendar sua variabilidade genômica e a possível relação desta com os desfechos clínicos apresentados. Os objetivos específicos do projeto são: a. Elucidar a variabilidade autóctone Nativo Americana e sua relação com a disseminação e evolução da COVID-19. b. Estabelecer a susceptibilidade genética desses indivíduos à infecção do SARS-CoV-2, e a dependência desta de fatores clínicos pré-existentes (i.e. diabetes, tuberculose). c. Modelar in sílico as alterações proteicas resultantes de mutações em regiões codificadores de genes já relacionados à evolução da COVID-19 (i.e. ACE2, IL-6, TMPRSS2), bem como de regiões altamente diferenciadas nos indivíduos com diferentes desfechos clínicos. d. Verificar o impacto das mutações achados na população nativa nos indivíduos miscigenados do projeto DNA do Brasil (1000 brasileiros já sequenciados), que apresentam diferentes graus de miscigenação com nativos americanos.

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CASTRO E SILVA, MARCOS ARAUJO; FERRAZ, TIAGO; COUTO-SILVA, CAINA M.; LEMES, RENAN B.; NUNES, KELLY; COMAS, DAVID; HUNEMEIER, TABITA. Population Histories and Genomic Diversity of South American Natives. Molecular Biology and Evolution, v. 39, n. 1, p. 17-pg., . (15/26875-9, 20/10136-0, 17/14916-8, 16/12371-1)