Micobioma associado a amostras de solos do centro-oeste paulista mediante sequenciamento de Nova-Geração (NGS): Análises e distribuição de espécies patogênicas

• Processo: 18/06390-9
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2018
• Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2020
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Eduardo Bagagli
• Beneficiário: Eduardo Bagagli
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Assunto(s): Solos Micobioma Fungos patogênicos Metagenômica Micologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: fungos patogênicos | metagenômica | Micobioma | Sequenciamento de Nova Geração (NGS) | solo | Micologia

Resumo

Apesar da reconhecida importância dos Fungos (Eumycota) em processos biotecnológicos e na área clínica, a ecologia destes organismos ainda é pouco compreendida, devido principalmente às dificuldades em isolar e cultivar laboratorialmente os microorganismos do ambiente. Neste contexto, o Sequenciamento de Nova Geração (NGS) revolucionou a Microbiologia, pois possibilita um sequenciamento de alta cobertura do DNA ambiental total (metagenoma), que permite uma ampla visão sobre a estrutura, diversidade e função da comunidade microbiana, sem a necessidade de isolamento dos organismos. A técnica está sendo amplamente empregada para compreensão mais robusta da ecologia dos microorganismos e tem sido aplicado nos estudos de micobiota. A ecologia é a chave para o entendimento de muitas doenças causadas por fungos patogênicos, principalmente de espécies dimórficas da ordem Onygenales, que engloba fungos do gênero Paracoccidioides, Histoplasma e Coccidioides, responsáveis por importantes micoses sistêmicas na América Latina. Várias evidências indicam que estes agentes apresentam distribuição restrita (endêmicas), localizada em micro-habitat, protegidos de radiação UV, variação de temperatura e intempéries, em solos enriquecidos com matéria orgânica de origem animal. Neste projeto, estamos propondo avaliar a diversidade fúngica por NGS em diferentes amostras de solos da região do Centro-Oeste paulista. Esperamos obter uma melhor compreensão dos fatores determinantes na distribuição ambiental das micobiotas, principalmente dos grupos com interesse clínico, contribuindo assim para adoção de possíveis medidas de prevenção. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

YAMAUCHI, DANIELLE HAMAE; GARCES, HANS GARCIA; TEIXEIRA, MARCUS DE MELO; BARROS RODRIGUES, GABRIEL FELLIPE; ULLMANN, LEILA SABRINA; GARCES, ADALBERTO GARCIA; HEBELER-BARBOSA, FLAVIA; BAGAGLI, EDUARDO. Soil Mycobiome Is Shaped by Vegetation and Microhabitats: A Regional-Scale Study in Southeastern Brazil. JOURNAL OF FUNGI, v. 7, n. 8, AUG 2021. (18/06390-9)

BAGAGLI, EDUARDO; MATUTE, DANIEL RICARDO; GARCES, HANS GARCIA; TENORIO, BERNARDO GUERRA; GARCES, ADALBERTO GARCIA; ALVES, LUCAS GOMES DE BRITO; YAMAUCHI, DANIELLE HAMAE; HRYCYK, MARLUCE FRANCISCA; BARKER, BRIDGET MARIE; TEIXEIRA, MARCUS DE MELO. Paracoccidioides brasiliensis Isolated from Nine-Banded Armadillos (Dasypus novemcinctus) Reveal Population Structure and Admixture in the Amazon Basin. JOURNAL OF FUNGI, v. 7, n. 1, JAN 2021. (18/06390-9)