O microbioma do pulmão de três jovens pacientes brasileiros com fibrose cística colonizados por fungo

• Processo: 20/13369-6
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2020
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2021
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia
• Pesquisador responsável: Marcia Regina von Zeska Kress
• Beneficiário: Marcia Regina von Zeska Kress
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Município da Instituição Sede: Ribeirão Preto
• Assunto(s): Aspergillus fumigatus
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Aspergillus fumigatus | Colonization | Cystic Fibrosis | lung microbiome | lung microbiota | metagenomic | Patogênese fúngica

Resumo

As comunidades microbianas infiltram o trato respiratório de pacientes com fibrose cística, onde a colonização crônica e infecção levam ao declínio clínico. Este estudo tem como objetivo fornecer uma visão geral da diversidade de espécies bacterianas e fúngicas da secreção das vias aéreas de três jovens pacientes com FC com doença pulmonar grave. Os microbiomas bacterianos e fúngicos foram investigados por meio de isolamento de cultura, metataxonomia e metagenômica shotgun. Fatores de virulência e genes de resistência a antibióticos também foram explorados. A. fumigatus foi isolado de culturas e identificado em alta incidência em amostras de escarro dos pacientes. Candida albicans, Penicillium sp., Hanseniaspora sp., Torulaspora delbrueckii e Talaromyces amestolkiae foram isolados esporadicamente. A metataxonomia e a metagenômica detectaram leituras fúngicas (Saccharomyces cerevisiae, A. fumigatus e Schizophyllum sp.) Em uma amostra de escarro. As principais bactérias patogênicas identificadas foram Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, complexo Burkholderia cepacia e Achromobacter xylosoxidans. O microbioma central canônico de FC é composto por espécies dos gêneros Streptococcus, Neisseria, Rothia, Prevotella e Haemophilus. Assim, as vias aéreas dos três jovens pacientes com FC apresentavam gêneros bacterianos dominantes e variabilidade interindividual na composição e diversidade da comunidade microbiana. Além disso, uma grande diversidade de fatores de virulência e genes de resistência a antibióticos foi identificada nos microbiomas pulmonares com FC, que podem estar ligados à condição clínica dos pacientes com FC. Compreender a comunidade microbiana é fundamental para melhorar a terapia, pois pode ter o efeito contrário, reestruturando a microbiota patogênica. Estudos futuros enfocando a influência de fungos na diversidade bacteriana e interações microbianas em microbiomas de FC serão bem-vindos para preencher essa enorme lacuna de influência de fungos na fisiopatologia da Fibrose Cística. (AU)