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One Health Brazilian Resistance (OneBR): base genômica integrada para vigilância, diagnóstico e tratamento da resistência aos antimicrobianos na interface humana-ambiente-animal, no Brasil

Processo: 20/08224-9
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de dezembro de 2020 - 31 de agosto de 2023
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Pesquisador responsável:Nilton Erbet Lincopan Huenuman
Beneficiário:Nilton Erbet Lincopan Huenuman
Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Microbiologia médica  Enterobacteriaceae  Farmacorresistência bacteriana  Genes de virulência  Genômica  Saúde Única 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Enterobacterales | Genômica | Microbiologia Clínica | Resistência Bacteriana | resistoma | Saúde Única | Microbiologia Clínica, Resistência bacteriana e Saúde Única

Resumo

A emergência e disseminação de bactérias resistentes a múltiplos agentes antimicrobianos tornaram-se um problema global de saúde pública que tem comprometido o tratamento eficaz de uma gama cada vez maior de infecções que afetam aos seres humanos e outros animais, repercutindo também na saúde ambiental, devendo, portanto, ser abordado como um problema de saúde única (One Health). Com relação a isto, a alta prevalência e endemicidade de espécies bacterianas como Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Salmonella enterica e Pseudomonas aeruginosa, nas infecções relacionadas à assistência à saúde (IRAS), tem sido suportada pela combinação bem-sucedida de fatores de virulência (viruloma) e presença de genes de resistência para antibióticos, desinfetantes e metais pesados (resistoma). Nesse contexto, destacam-se os determinantes genéticos de resistência mobilizados por plasmídeos, com ênfase na produção de beta-lactamases de amplo espectro (ESBLs), carbapenemases (KPC, NDM) e resistência transferível à colistina (MCR). Como um agravante, no Brasil, a disseminação desses determinantes genéticos nesses patógenos tem ocorrido de forma dinâmica na interface humana-ambiente-animal, com uma rápida adaptação de clones considerados de alto risco, como por exemplo, E. coli ST10, ST38, ST131, ST224, e ST648; K. pneumoniae do CC258; e P. aeruginosa ST277. Desse modo, utilizando-se uma abordagem genômica, o presente estudo tem como objetivo esclarecer aspectos relacionados ao resistoma, viruloma, mobiloma e plasmidoma de linhagens endêmicas/pandêmicas de bactérias Gram-negativas clinicamente significantes, isoladas de diferentes hospedeiros e ecossistemas. Para esse fim, será criado um banco de dados de genômica integrada de fácil acesso, nomeada "OneBR" (One Health Brazilian Resistance), que possibilitará a vigilância, diagnóstico e o tratamento da resistência aos antimicrobianos dentro do conceito One Health. O benefício do presente estudo será decorrente da disponibilização de dados genômicos (big data) numa plataforma gratuita de fácil acesso por profissionais e pesquisadores da área da saúde humana, animal e ambiental, que a priori permitirá elucidar aspectos genéticos de adaptação, resistência e virulência destes patógenos considerados de prioridade crítica pela organização mundial da saúde (OMS), circulando na interface humana-ambiente-animal, no Brasil. (AU)

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Aumenta nos hospitais brasileiros a presença de bactérias resistentes a antibióticos 
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Publicações científicas (15)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
GAETA, NATALIA C.; DE CARVALHO, DANIEL U.; FONTANA, HERRISON; SANO, ELDER; MOURA, QUEZIA; FUGA, BRUNA; MUNOZ, PATRICIO MONTECINOS; GREGORY, LILIAN; LINCOPAN, NILTON. Genomic features of a multidrug-resistant and mercury-tolerant environmental Escherichia coli recovered after a mining dam disaster in South America. Science of The Total Environment, v. 823, p. 9-pg., . (16/23204-9, 20/08224-9)
ESPOSITO, FERNANDA; CARDOSO, BRENDA; SELLERA, FABIO P.; SANO, ELDER; FUENTES-CASTILLO, DANNY; FONTANA, HERRISON; FUGA, BRUNA; MOURA, QUEZIA; SATO, MARIA I. Z.; BRANDAO, CARLOS J.; et al. Expansion of healthcare-associated hypervirulent KPC-2-producing Klebsiella pneumoniae ST11/KL64 beyond hospital settings. ONE HEALTH, v. 17, p. 6-pg., . (19/15578-4, 20/08224-9)
VASQUEZ-PONCE, FELIPE; BISPO, JESSICA; BECERRA, JOHANA; FONTANA, HERRISON; PARIONA, JESUS G. M.; ESPOSITO, FERNANDA; FUGA, BRUNA; OLIVEIRA, FLAVIO A.; BRUNETTI, FLORENCIA; POWER, PABLO; et al. Emergence of KPC-113 and KPC-114 variants in ceftazidime-avibactam-resistant Klebsiella pneumoniae belonging to high-risk clones ST11 and ST16 in South America. MICROBIOLOGY SPECTRUM, v. N/A, p. 9-pg., . (19/15578-4, 20/08224-9)
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ESPOSITO, FERNANDA; CARDOSO, BRENDA; FONTANA, HERRISON; FUGA, BRUNA; CARDENAS-ARIAS, ADRIANA; MOURA, QUEZIA; FUENTES-CASTILLO, DANNY; LINCOPAN, NILTON. Genomic Analysis of Carbapenem-Resistant Pseudomonas aeruginosa Isolated From Urban Rivers Confirms Spread of Clone Sequence Type 277 Carrying Broad Resistome and Virulome Beyond the Hospital. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 12, . (20/08224-9, 19/15578-4)
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FUGA, BRUNA; SELLERA, FABIO P.; CERDEIRA, LOUISE; ESPOSITO, FERNANDA; CARDOSO, BRENDA; FONTANA, HERRISON; MOURA, QUEZIA; CARDENAS-ARIAS, ADRIANA; SANO, ELDER; RIBAS, ROSINEIDE M.; et al. WHO Critical Priority Escherichia coli as One Health Challenge for a Post-Pandemic Scenario: Genomic Surveillance and Analysis of Current Trends in Brazil. MICROBIOLOGY SPECTRUM, v. 10, n. 2, p. 18-pg., . (19/15578-4, 20/08224-9)
FONTANA, HERRISON; CARDOSO, BRENDA; ESPOSITO, FERNANDA; DE LIMA, ALINE VALERIO; MELLO SAMPAIO, JORGE LUIZ; LINCOPAN, NILTON. mall IncQ1 Plasmid Encoding KPC-2 Expands to Invasive Nontyphoidal Salmonell. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, v. 65, n. 11, . (20/08224-9)
VASQUEZ-PONCE, FELIPE; DANTAS, KARINE; BECERRA, JOHANA; MELOCCO, GREGORY; ESPOSITO, FERNANDA; CARDOSO, BRENDA; RODRIGUES, LARISSA; LIMA, KEILA; DE LIMA, ALINE, V; SELLERA, FABIO P.; et al. Detecting KPC-2 and NDM-1 Coexpression in Klebsiella pneumoniae Complex from Human and Animal Hosts in South America. MICROBIOLOGY SPECTRUM, v. N/A, p. 12-pg., . (19/15578-4, 20/08224-9)
SELLERA, FABIO P.; FUENTES-CASTILLO, DANNY; FUGA, BRUNA; GOLDBERG, DAPHNE W.; KOLESNIKOVAS, CRISTIANE K. M.; LINCOPAN, NILTON. New Delhi metallo-β-lactamase-1-producing Citrobacter portucalensis belonging to the novel ST264 causing fatal sepsis in a vulnerable migratory sea turtle. ONE HEALTH, v. 17, p. 5-pg., . (20/08224-9)
SANO, ELDER; FONTANA, HERRISON; ESPOSITO, FERNANDA; CARDOSO, BRENDA; FUGA, BRUNA; COSTA, GLADYSTON C. V.; BOSQUEIRO, TATIANA C. M.; SINHORINI, JULIANA A.; ORICO, LILIAN D.; DE MASI, EDUARDO; et al. Genomic analysis of fluoroquinolone-resistant Leclercia adecarboxylata carrying the ISKpn19- orf- qnrS1- Delta IS3-blaLAP-2 module in a synanthropic pigeon, Brazil. JOURNAL OF GLOBAL ANTIMICROBIAL RESISTANCE, v. 33, p. 4-pg., . (20/08224-9)
SACRAMENTO, ANDREY G.; FUGA, BRUNA; MONTE, DANIEL F. M.; CARDOSO, BRENDA; ESPOSITO, FERNANDA; DOLABELLA, SILVIO S.; BARBOSA, ANA A. T.; ZANELLA, ROSEMEIRE C.; CORTOPASSI, SILVIA R. G.; DA SILVA, LUCIANO C. B. A.; et al. Genomic features of mecA-positive methicillin-resistant Mammaliicoccus sciuri causing fatal infections in pets admitted to a veterinary intensive care unit. Microbial Pathogenesis, v. 171, p. 6-pg., . (20/08224-9)
SELLERA, FABIO P.; FERNANDES, MIRIAM R.; FUGA, BRUNA; FONTANA, HERRISON; VASQUEZ-PONCE, FELIPE; GOLDBERG, DAPHNE W.; MONTE, DANIEL F.; RODRIGUES, LARISSA; CARDENAS-ARIAS, ADRIANA R.; LOPES, RALF; et al. Phylogeographical Landscape of Citrobacter portucalensis Carrying Clinically Relevant Resistomes. MICROBIOLOGY SPECTRUM, v. 10, n. 2, p. 7-pg., . (19/15578-4, 20/08224-9, 15/13527-2)
DALAZEN, GISLAINE; FUENTES-CASTILLO, DANNY; PEDROSO, LUIZ G.; FONTANA, HERRISON; SANO, ELDER; CARDOSO, BRENDA; ESPOSITO, FERNANDA; MOURA, QUEZIA; MATINATA, BIANCA S.; SILVEIRA, LUIZ F.; et al. CTX-M-producing Escherichia coli ST602 carrying a wide resistome in South American wild birds: Another pandemic clone of One Health concern. ONE HEALTH, v. 17, p. 7-pg., . (19/15578-4, 20/08224-9)
BUERIS, VANESSA; SELLERA, FABIO P.; FUGA, BRUNA; SANO, ELDER; CARVALHO, MARCELO P. N.; COUTO, SAMUEL C. F.; MOURA, QUEZIA; LINCOPAN, NILTON. Convergence of virulence and resistance in international clones of WHO critical priority enterobacterales isolated from Marine Bivalves. SCIENTIFIC REPORTS, v. 12, n. 1, p. 12-pg., . (20/08224-9)

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