Genética de paisagens e genômica comparativa: uma abordagem integrada no estudo evolutivo de invertebrados marinhos

• Processo: 21/06738-8
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOTA - Jovens Pesquisadores - Fase 2
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2022
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2027
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Sónia Cristina da Silva Andrade
• Beneficiário: Sónia Cristina da Silva Andrade
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Gonzalo Giribet ; Hugo Benitez ; Maikon Di Domenico ; Marcelo Dottori
• Vinculado ao auxílio: 15/20139-9 - Genética de paisagens marinha e avaliação de perfis de expressão em invertebrados marinhos na costa sudeste brasileira, AP.JP
• Auxílio(s) vinculado(s): 23/01413-9 - Investigação da cadeia de Vitória e Trindade como barreira ao fluxo gênico em Colpomenia sinuosa (Ectocarpales, Phaeophyceae), AP.R
• Bolsa(s) vinculada(s): 25/00613-0 - Investigando a tribo Rhinotragini (Coleoptera, Cerambycidae, Cerambycinae) através da revisão taxonômica de "Chariergodes" Zajciw, 1963 e análise genômica comparativa de gêneros próximos., BP.MS; 24/20492-0 - Análises morfológicas e molecular da espécie Bellactis ilkalyseae (Cnidaria: Actiniaria) do litoral brasileiro, com a (re)descrição da espécie, BP.IC; 24/21688-5 - Diversidade genômica de Ozobranchus (Ozobranchidae: Hirudinida): padrões de fluxo gênico e relações de parentesco da espécie Ozobranchus margoi, parasita de tartarugas marinhas na costa brasileira, BP.IC; + mais bolsas vinculadas 24/16456-8 - Capacidades regenerativas em Spiralia: uma abordagem integrada para o estudo de processos regenerativos, BP.IC; 21/12924-9 - Investigação da cadeia de Vitória e Trindade como barreira ao fluxo gênico em Colpomenia sinuosa (Ectocarpales, Phaeophyceae), BP.PD; 22/14490-9 - Genômica de Coronula diadema e Xenobalanus globicipitis e identificação de genes relacionados à associação ecológica entre cracas e cetáceos, BP.PD; 22/13979-4 - A história evolutiva dos Piolhos-de-Baleia: de adaptações específicas à filogenia da família, BP.PD; 22/12534-9 - Filogeografia e padrão de diversidade genética em espécies da meiofauna, BP.IC; 22/10285-1 - Diversidade da comunidade de meiofauna de corpo mole do sudeste brasileiro, BP.IC - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Biologia evolutiva Genética populacional Genômica comparativa Filogenia molecular Demografia histórica Meiofauna
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: conectividade e demografia histórica | Genética de populações | genômica comparativa | Meiofauna | organismos epibiontes | Sistemática Molecular | Biologia Evolutiva

Resumo

Inferir como as relações históricas entre populações naturais se reflete nos padrões de variabilidade genética é um dos desafios da disciplina de genética de paisagens. Essa abordagem permite a compreensão das relações entre a distribuição das populações na matriz geográfica e o fluxo gênico, regulado pelas características ambientais e bionômicas. Uma das muitas possibilidades dentro da genética de paisagens marinha é a análise de associação entre os dados dos marcadores genéticos com potencial papel funcional e características descritivas ambientais. Entretanto, essa associação tem um alcance limitado, uma vez que em organismos não modelo a anotação dos locos associados é limitada pelos bancos de dados. Para resolver esse problema, análises comparativas genômicas podem ser empregadas para estudar a base genética da evolução fenotípica/funcional do caráter. Nesse contexto, a presente proposta explora três aspectos potencialmente fundamentais no estabelecimento de uma ponte entre diversidade genética e traços adaptativos em dois ambientes marinhos restritivos e pouco estudados. Primeiramente, caracterizar e entender a um nível genômico/transcriptômico as diferenças interespecíficas da resposta a pressões ambientais. Em segundo lugar, avaliar a distribuição da variabilidade genética acompanhada por dados ambientais e de circulação oceânica. Finalmente, usando abordagens filogenéticas, ferramentas comparativas (PhyloG2P, PhyloAcc), dados genômicos, transcriptomas e marcadores UCEs, serão testadas associações evolutivas entre diversificação de linhagens e traços adaptativos/funcionais, identificando e distinguindo a similaridade causada por evolução convergente da causada pela ancestralidade compartilhada. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

CORTEZ, THAINA; MARANGONI, GIULIA; ANDRADE, SONIA CRISTINA DA SILVA; DI DOMENICO, MAIKON. Sediment effects on interstitial faunal distribution in Brazilian sandy beaches: a multi-phylum approach. MARINE AND FRESHWATER RESEARCH, v. 76, n. 2, p. 11-pg., 2025-01-01. (21/06738-8)

SONODA, GABRIEL GONZALEZ; TOBARUELA, ERIC DE CASTRO; NORENBURG, JON; FABI, JOAO PAULO; ANDRADE, SONIA C. S.. Venomous Noodles: The Evolution of Toxins in Nemertea through Positive Selection and Gene Duplication. TOXINS, v. 15, n. 11, p. 27-pg., 2023-11-01. (15/20139-9, 18/12502-4, 21/06738-8, 20/06467-1)