EMU científico: aquisição de Plataforma NanoString GeoMx Digital Profiler para a implantação do Laboratório Multidisciplinar de Multiômica Espacial (LMME)

• Processo: 22/11571-8
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Infraestrutura - Científico
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2023
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2030
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Soraya Soubhi Smaili
• Beneficiário: Soraya Soubhi Smaili
• Instituição Sede: Instituto Nacional de Farmacologia (INFAR). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Andrea Parolin Jackowski ; Caroline Serrano Do Nascimento ; Cesar Seigi Fuziwara ; Fabiano Beraldi Calmasini ; Janete Maria Cerutti ; João Bosco Pesquero ; Karina Possa Abrahão ; Luiz Mário Ramos Janini ; Maria Aparecida Juliano ; Maria Isabel de Souza Aranha Melaragno ; Reinaldo Salomão ; Roberta Sessa Stilhano Yamaguchi ; Rui Monteiro de Barros Maciel ; Ruy Ribeiro de Campos Junior ; Vilma Regina Martins
• Bolsa(s) vinculada(s): 24/14315-8 - Programa de Treinamento, Manuseio e Gestão dos equipamentos designados para atividades de Multiômica Espacial para pesquisas nas áreas de Oncologia, Neurociência e Imunologia, BP.TT; 23/18082-5 - Programa de Treinamento, Manuseio e Gestão dos equipamentos designados para atividades de Multiômica Espacial para pesquisas nas áreas de Oncologia, Neurociência e Imunologia, BP.TT
• Assunto(s): Análises multiômicas Imunologia Transcriptoma Neurociências Oncologia Aquisição de equipamentos Equipamentos multiusuários Infraestrutura de pesquisa
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Imunologia | Neurociência | ômica espacial | Oncologia | Transcriptoma | Multiômica Espacial

Resumo

O presente projeto propõe a instalação de uma plataforma de análise multiômica, por meio da aquisição um equipamento composto de dois módulos. O equipamento GeoMx e o nCounter têm a capacidade de coletar e analisar dados de regiões específicas de tecidos frescos ou congelados. O fluxo de trabalho do GeoMx DSP se integra perfeitamente aos fluxos de trabalho atuais de histologia ou genômica para ajudar os pesquisadores a obter dados multiômicos espaciais robustos e reproduzíveis rapidamente. Além disso, o nCounter pode ser utilizado individualmente para análise direta de ácidos nucleicos (DNA, RNAs) sem a análise espacial. Desta forma, o tecido analisado para a expressão espacial e que não foi danificado após análise, por exemplo, pode ser utilizado para isolamento do DNA e quantificação, para avaliar se houve alteração no número de cópias dos genes alvos (CNA, do inglês copy number alteration), sem preparo de bibliotecas de genoma completo. A metodologia permite análises multiômicas que têm diferentes aplicações, sendo, portanto, um equipamento de aplicação multidisciplinar, permitindo uma utilização por diferentes pesquisadores de diferentes áreas, tais como oncologia, neurociência, imuno-oncologia, imunologia. Podem ser utilizados cortes histológicos humanos em uma abordagem clínica, bem como amostras de modelos experimentais.No presente projeto, apresentamos uma lista de 17 pesquisadores associados, além de 27 projetos complementares. Foram reunidos pesquisadores da Escola Paulista de Medicina (Campus São Paulo/Unifesp), bem como do Instituto de Ciências Ambientais, Químicas e Farmacêuticas, do Instituto de Ciência e Tecnologia e do Instituto do Mar, de diferentes Campi da Unifesp. Além destes, foram incluídos pesquisadores da USP, Santa Casa, São Camilo, ICESP e AC Camargo.O equipamento a ser adquirido será fundamental para a implantação do Laboratório Multidisciplinar de Multiômica Espacial (LMME) que terá colaboração com o Laboratório de Identificação Humana (Labih), onde se encontra a plataforma Illumina recém adquirida pela Unifesp. (https://nanostring.com/products/geomx-digital-spatial-profiler/geomx-dsp-overview/)O LMME estará localizado no Edifício de Pesquisas 2 da EPM / Unifesp, onde estão diversos laboratórios e em colaboração com o Instituto de Farmacologia e Biologia Molecular (Infar). A experiência do Infar, adquirida com plataformas multiusuárias nos últimos 20 anos, será a base da utilização do equipamento, com transparência e equidade. A aquisição do GeoMx e do nCounter possilitará a realização de pesquisas de ponta e inéditas em nosso país, elevando a qualidade dos resultados dos pesquisadores e das pesquisas, tornando-as competitivas internacionalmente e elevando o impacto das publicações e resultados aplicados à pesquisa clínica. (AU)