Caracterização da fauna de foraminíferos recentes da Enseada do Flamengo (Ubatuba, SP) com a utilização de ferramentas biomoleculares

• Processo: 09/10842-3
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2009
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2012
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Oceanografia - Oceanografia Biológica
• Pesquisador responsável: Vivian Helena Pellizari
• Beneficiário: Vivian Helena Pellizari
• Instituição Sede: Instituto Oceanográfico (IO). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Ecologia molecular Biodiversidade Foraminifera Reação em cadeia por polimerase (PCR) Biblioteca gênica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: biodiversidade marinho | Ecologia molecular | Filogenia | Foraminíferos | variáveis ambientais | Ecologia molecular microrganismos

Resumo

O presente projeto de pesquisa pretende avaliar a biodiversidade de foraminíferos na Enseada do Flamengo (Ubatuba, SP) com auxílio de ferramentas biomoleculares e, através da relação da riqueza e diversidade de espécies determinadas pela biologia molecular e análises multivariadas com parâmetros ambientais, comparar e relacionar os resultados obtidos com a determinação de associações de foraminíferos recentes com a da técnica clássica, amplamente utilizada em estudos com distribuição de foraminíferos recente e sub-recentes, para abordagens ecológicas, oceanográficas e micropaleontológicas. O sedimento de fundo marinho na Enseada do Flamengo será amostrado com auxílio de um Van Veen em 33 estações de amostragem, onde além do sedimento para análise da fauna de foraminíferos serão determinadas variáveis abióticas do meio e material para granulometria e geoquímica. As amostras para análise de foraminíferos pelo método clássico irão determinar abundância, riqueza e alguns índices ecológicos tanto para a fauna viva (testas coradas com Rosa de Bengala) como para a morta (testas não coradas), das 33 estações amostradas serão avaliados seis estações para análise para determinação da riqueza e diversidade de foraminíferos através da extração de DNA total do sedimento de fundo, realização de análise de PCR com primers espécies-específicos para foraminíferos e, a partir da construção de bibliotecas genômicas, será realizado o sequenciamento do material resultante e cálculo de riqueza e índices ecológicos. Análises de correlação entre os dados obtidos nas duas abordagens (clássica e biomolecular) serão realizados com os valores de riqueza e índices ecológicos. Análises multivariadas como PCA e MDS serão realizadas com os resultados obtidos nas duas abordagens de forma separada também serão utilizadas como parâmetro comparativo. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

RODRIGUES, ANDRE ROSCH; PELLIZARI, VIVIAN HELENA; ALMEIDA, CRISTIANO DE SALLES; DE SOUSA, EDUINETTY CECI P. M.; HOLZMANN, MARIA; PAWLOWSKI, JAN. New phylotypes of foraminifera in subtropical Brazilian coastal waters revealed by environmental DNA metabarcoding. JOURNAL OF SEDIMENTARY ENVIRONMENTS, v. 6, n. 1, p. 11-pg., 2021-02-04. (09/10842-3, 09/13666-1)

RODRIGUES, ANDRE ROSCH; PELLIZARI, VIVIAN HELENA; ALMEIDA, CRISTIANO DE SALLES; DE SOUSA, EDUINETTY CECI P. M.; HOLZMANN, MARIA; PAWLOWSKI, JAN. New phylotypes of foraminifera in subtropical Brazilian coastal waters revealed by environmental DNA metabarcoding. JOURNAL OF SEDIMENTARY ENVIRONMENTS, v. 6, n. 1, FEB 2021. (09/10842-3, 09/13666-1)