SUCEST - data mining

• Processo: 99/02845-9
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa GENOMA
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 1999
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2002
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Helaine Carrer
• Beneficiário: Helaine Carrer
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Biblioteca gênica Expressão gênica Análise de sequência de DNA Transcrição genética Cana-de-açúcar Genoma Cana-de-Açúcar - SucEST
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biblioteca Cdna | Cana-De-Acucar | Est | Expressao Genica | Sequenciamento De Dna | Sinais De Transcricao

Resumo

A região de regulação de genes eucarióticos contém seqüências específicas de DNA as quais controlam a transcrição de um gene. Tais seqüências agem pela ligação de uma ou um grupo de proteínas, conhecidas como fatores de transcrição, a fim de modular a expressão de genes. Apesar das seqüências primárias de certos fatores de transcrição se mostrarem conservadas, o papel regulatório que estes fatores desempenham tem sido alterados no decorrer da evolução, para se ajustar a necessidade de cada organismo. Nosso interesse nesse projeto é a identificação de fatores de transcrição de cana de açúcar que apresentem homologia com proteínas já conhecidas de Saccharomyces cerevisiae envolvidas na transcrição de genes reprimidos por glicose. Esse mecanismo é extremamente estudado nessa levedura e diversas proteínas que participam desse processo já foram identificadas, entre elas: SNF1, SNF2, SNF3, SNF4, SNF5, HAP1, HAP2, HAP3, HAP4, HAP5, TUPI, SSN6 e MIG1, as quais foram utilizadas como palavra chave para encontrar ESTs homólogos em cana de açúcar. (AU)