Laboratório de validação para a caracterização de genes humanos completos identificados no Projeto Genoma Humano do Câncer

• Processo: 00/12487-1
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa GENOMA
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2000
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2003
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Daniel Giannella Neto
• Beneficiário: Daniel Giannella Neto
• Instituição Sede: Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP (HCFMUSP). Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Análise de sequência de DNA Neoplasias Genes Genomas Genoma Humano do Câncer
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biologia Molecular | Cancer | Genes Completos | Genoma | Sequenciamento

Resumo

O objetivo deste projeto é o de validar a estrutura e definir as sequências de pelo menos 2.000 genes humanos completos durante o período de 2 anos. Ao contrário dos projetos de sequenciamento convencional de cDNA completo, tal como o MGC, a estrutura gênica será caracterizada e validada sem a construção de bibliotecas de cDNA altamente elaboradas ou da determinação de transcritos completos. As sequências gênicas serão selecionadas a partir das sequências já disponíveis do Projeto Genoma Humanas do Câncer. Estas sequências serão usadas como moldes para o mapeamento de marcadores de sequencias expressas (EST, convencional ou ORESTES), como também, para identificação por análise computacional. A construção dos iniciadores para a validação de supostos genes será baseada no mapeamento de EST, predição computacional de exons e padrões de organização genômica, tais como, comprimento médio de genes, exon/intron e distribuição. A validação será realizada por RT -PCR, subclonagem de insertos e sequenciamento. Um banco de dados permitirá a catalogação de genes será criado e também de informações adicionais sobre localização cromossômica, padrão de expressão, formas transcricionais alternativas, etc. Os genes a serem sequenciados estarão em conformidade com outros cDNA sequenciados em projetos internacionais para evitar duplicidade. (AU)