Microssatellite data mining

• Processo: 00/07427-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa GENOMA
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2000
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2002
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Eugenio Cesar Ulian
• Beneficiário: Eugenio Cesar Ulian
• Instituição Sede: Centro de Tecnologia Copersucar. Cooperativa de Produtores de Cana-de-Açúcar, Açúcar e Álcool do Estado de São Paulo (COPERSUCAR). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Mapeamento genético Marcador molecular Mineração de dados
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Genetico | Mapeamento | Marcador | Microssatelite | Molecular

Resumo

Marcadores moleculares baseados em Sequências Simples Repetidas (SSR) têm sido extremamente úteis para estudos de genética e melhoramento de plantas. Uma vez desenvolvidos, estes marcadores são de fácil aplicação. Porém, a metodologia para desenvolver estes marcadores é complexa e dispendiosa, limitando sua aplicação em grandes culturas como a cana-de-açúcar. A descoberta de SSR em sequências expressas de DNA, trouxe a oportunidade de desenvolver microssatélites de forma simples e direta, através da busca (Data mining) em base de dados de ESTs (Expressed Sequence Tags). O presente trabalho visa à identificação de SSRs na Base de Dados SUCEST, com vistas a desenvolver marcadores microssatélites para cana-de-açúcar, atualmente inexistentes no Brasil. Estes marcadores serão prontamente incorporados ao trabalho de mapeamento genético e seleção assistida por marcadores, atualmente em curso no Centro de Tecnologia Copersucar. (AU)