Head and neck and esophageal squamous cell carcinoma: biomarkers derived from genomics and proteomics.

• Processo: 02/01520-3
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa GENOMA
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2002
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2005
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Eloiza Helena Tajara da Silva
• Beneficiário: Eloiza Helena Tajara da Silva
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP). São José do Rio Preto , SP, Brasil
• Município da Instituição Sede: São José do Rio Preto
• Bolsa(s) vinculada(s): 03/05054-0 - Genoma clinico., BP.TT
• Assunto(s): Neoplasias de cabeça e pescoço Neoplasias esofágicas Proteômica Genoma Humano do Câncer Processamento alternativo Modelagem molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Alternative Splicing | Esophageal Carcinoma | Head And Neck Carcinoma | Microarray | Molecular Modeling | Proteomics

Resumo

The primary aim of the present project is to search for new tumor markers that may be relevant both for diagnosis, prognosis and classification of head and neck (HN) and esophageal (E) squamous cell carcinomas, and for more effective therapeutic measures. Specific aims include: (1) By using genomic and proteomic approaches, investigate differences in gene and protein expression profiles between HN/E carcinomas and their apparently normal counterparts. (2) Evaluate the structure of proteins which have potential of playing a functional role in the induction and/or sustenance of malignant phenotypes in humans. By molecular modeling, obtain three-dimensional structures of possible protein targets identified in the project. (3) By quantitative real time RT-PCR analysis, investigate the expression of markers identified in the projects FAPESP 00/103095-2, FAPESP 00/12739-0 and Clinical Genomics. (4) Determine the frequency of variants of expressed genes which showed evidence of alternative splicing in Human Cancer Genome Project. (AU)

Publicações científicas

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ALVES, V. A. F.; NONOGAKI, S.; CURY, P. M.; WUENSCH-FILHO, V.; DE CARVALHO, M. B.; MICHALUART-JUNIOR, P.; MOYSES, R. A.; CURIONI, O. A.; FIGUEIREDO, D. L. A.; SCAPULATEMPO-NETO, C.; et al. . Histopathology, v. 53, n. 6, p. 715-727, DEC 2008. (02/01511-4, 02/07304-0, 02/01520-3, 04/12054-9, 02/01503-1)