Diversidade molecular dos genes codificadores das proteínas não-estruturais NSP2 e protease papaína-like em linhagens brasileiras do vírus da bronqiuite infecciosa das galinhas

• Processo: 11/00603-1
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2011
• Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2013
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Paulo Eduardo Brandão
• Beneficiário: Paulo Eduardo Brandão
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FMVZ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Virologia Viroses em animais Galinhas Infecções por Coronavirus Gammacoronavirus Vírus da bronquite infecciosa Glicoproteína da espícula de Coronavirus Carga viral Papaína Análise de sequência de DNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Coronavirus | Protease papaína-like | Proteína S | Proteínas não estruturais | Vírus da Bronquite Infecciosa | Virologia

Resumo

A bronquite infecciosa das galinhas (BIG), causada pelo vírus da bronquite infecciosa das galinhas (IBV) é considerada endêmica no Brasil, apesar do amplo emprego de vacinas, em decorrência da contínua emergência e dissemiação de novos tipos virais. A proteína estrutural S (espícula) é o principal alvo de estudos genotípicos e filogenéticos para este vírus. Entretanto, a maior parte do genoma do IBV codifica proteínas não estruturais, incluindo proteases, as quais se constituem em regiões genômicas insuficientemente exploradas em termos de diversidade de linhagens virais. O objetivo do presente estudo é estudar a diversidade dos genes codificadores da protease papaína-like (PLpro), da proteína não estrutural 2 (nsp2) e S em amostras brasileiras de IBV. Para isso, serão investigados pools de órgãos (trato respiratório, rim, aparelho reprodutivo e conteúo entérico) de poedeiras, frangos de corte e reprodutoras comerciais, com sinais clínicos de BIG. Será realizada triagem por RT-PCR-Nested para a região 3'UTR, seguida de Nested-RT-PCR para o gene S e RT-PCR para os genes da PLpro e nsp2 e, por fim, sequenciamento de DNA e análise genealógica dos fragmentos obtidos. Adicionalmente, essas amostras serão submetidas à PCR quantitativa para o mRNA para proteína M, para quantificação da carga viral. Pretende-se realizar: a análise genealógica comparativa das sequências para os genes investigados; a verificação da existência de marcadores moleculares para as diferentes manifestações clínicas e sua associação com a carga viral detectada. Espera-se com isso, contribuir para um conhecimento mais amplo da evolução do IBV, bem como de seus mecanismos de tropismo e patogenicidade, com a finalidade de auxiliar no delineamento de medidas profiláticas mais eficientes. (AU)