EMU: aquisição de sistema com plataforma para microdissecção por captura a laser aplicada em estudos de biologia celular e molecular

• Processo: 09/53998-3
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2010
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2014
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Biologia Geral
• Pesquisador responsável: Tsai Siu Mui
• Beneficiário: Tsai Siu Mui
• Instituição Sede: Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Proteômica Genômica DNA RNA Microdissecção
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Celula Especifica | Dna | Genomica Funcional | Microdisseccao A Laser | Proteomica | Rna
• Publicação FAPESP: https://media.fapesp.br/bv/uploads/publicacoes/emu_bio_71.pdf
• Página web do EMU: Página do Equipamento Multiusuário não informada
• Tipo de equipamento: Tipo de Equipamento Multiusuário não informado
• Fabricante: Fabricante não informado
• Modelo: Modelo não informado

Resumo

O projeto solicita a aquisição de plataforma com sistema para tecnologia de microdissecção a laser (MCl) por gravidade e movimentação de feixe de laser sobre amostras, para possibilitar estudos por dissecção e captura de células de um tecido ou da rizosfera, e ao mesmo tempo garantindo alto desempenho em termos de velocidade e precisão da microdissecção de amostras com diferentes espessuras. Esta tecnologia tem sido aplicada para obter células de plantas e animais, e mais recentemente para estudar as interações planta-microrganismos. Particularmente, as técnicas usadas em estudos nas interações planta-microrganismos são de grande relevância para as pesquisas planta-patógeno e planta-microrganismos mutualísticos. A proposta do uso do sistema de microdissecção a laser pela equipe será de inserir análises de expressão gênica (proteômica) em sítios específicos (transcrição e expressão espaciais), pois permite o isolamento de RNA dessas amostras e a informação do perfil dos transcritos, uma investigação da funcionalidade desses genes, e determinar a base molecular dos processos ativos na amostra. O sistema é acompanhado de aparatos para motorização de microscópio para captura e sobreposição de imagens em fluorescência e controle das funções do sistema para microdissecção a laser. Seu custo estimado é de 182.720 euros. O sistema deverá servir para apoiar pesquisas no Cena- USP e aos projetos associados do Departamento de Fisiologia Vegetal (IB-UNICAMP) e do Departamento de Biologia (FFC/RP- USP), com projetos complementares: Esalq/ USP (departamentos de Ciências Biológicas, Fitopatologia e Nematologia e Núcleo de Apoio à Pesquisa em Microscopia Eletrônica Aplicada à Pesquisa Agropecuária (NAP/Mepa), Faculdade de Odontologia (FOP-UNICAMP), Instituto de Botânica (UNICAMP), Instituto de Biologia - UFRJ, Cenargen-EMBRAPA, que utilizam de métodos tais como hibridização in situ, imunolocalização e visualização de gene-repórter e que têm requerido a análise célula-específica da expressão de genes individuais e o acúmulo de proteínas individuais. O sistema MCL constitui-se como um novo método que tem sido desenvolvido e pode fornecer esta informação celular em uma larga escala genômica e proteômica. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

GRACAS, J. P.; RUIZ-ROMERO, R.; FIGUEIREDO, L. D.; MATTIELLO, L.; PERES, L. E. P.; VITORELLO, V. A.. Root growth restraint can be an acclimatory response to low pH and is associated with reduced cell mortality: a possible role of class III peroxidases and NADPH oxidases. Plant Biology, v. 18, n. 4, p. 658-668, JUL 2016. (09/53998-3)

BUSSO-LOPES, ARIANE F.; NEVES, LEANDRO X.; CAMARA, GUILHERME A.; GRANATO, DANIELA C.; PRETTI, MARCO ANTONIO M.; HEBERLE, HENRY; PATRONI, FABIO M. S.; SA, JAMILE; YOKOO, SAMI; RIVERA, CESAR; et al. Connecting multiple microenvironment proteomes uncovers the biology in head and neck cancer. NATURE COMMUNICATIONS, v. 13, n. 1, p. 24-pg., 2022-11-07. (19/21815-9, 15/19191-6, 15/50612-8, 09/53998-3, 18/18496-6, 11/00417-3, 09/54067-3, 10/19278-0, 16/07846-0)

CARNIELLI, CAROLINA MORETTO; SOARES MACEDO, CAROLINA CARNEIRO; DE ROSSI, TATIANE; GRANATO, DANIELA CAMPOS; RIVERA, CESAR; DOMINGUES, ROMENIA RAMOS; PAULETTI, BIANCA ALVES; YOKOO, SAMI; HEBERLE, HENRY; BUSSO-LOPES, ARIANE FIDELIS; et al. Combining discovery and targeted proteomics reveals a prognostic signature in oral cancer. NATURE COMMUNICATIONS, v. 9, SEP 5 2018. (16/07846-0, 09/54067-3, 13/16483-0, 10/19278-0, 09/53998-3)