Caracterização genômica e funcional de transposons mutator em cana-de-açúcar

• Processo: 03/08890-3
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2004
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2008
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Maria Magdalena Rossi
• Beneficiário: Maria Magdalena Rossi
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 07/54162-0 - O sistema Mutator em cana-de-açúcar: uma análise comparativa com arroz, BP.MS; 04/01437-4 - Caracterização genômica e funcional de transposons mutator em cana-de-açúcar, BP.JP
• Assunto(s): Clonagem Cana-de-açúcar
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cana De Acucar | Clonagem | Mutator | Transposase | Transposons
• Publicação FAPESP: https://media.fapesp.br/bv/uploads/pdfs/Investindo...pesquisadores_159_140_140.pdf

Resumo

Os elementos de transposição (TEs) constituem parte importante do material genético dos eucariontes, podendo representar desde 45 % em humanos até 50-80 % no genoma de gramíneas. No banco de dados do SUCEST, foi encontrado um abundante espectro de TEs sendo expressos. O elemento mais frequente foi o transposon MuDR. Resultados obtidos em nosso laboratório revelaram que existem pelo menos três classes destes transposons em plantas e que estas existiam previamente à divergência entre mono e dicotiledôneas. Dentro de cada uma das classes são mantidas as relações filogenéticas entre as espécies. Cada classe apresenta padrões de inserção genômica, assim como frequência de 'stop codons' e 'frame shifts' distintos, estas observações sugerem diferenças nos níveis de atividade dos elementos. Neste contexto, este projeto visa a clonagem de elementos MuDR de cana de açúcar para sua posterior caracterização genômica e funcional, sendo os objetivos específicos: a clonagem de pelo menos um elemento MuDR para cada uma das três classes identificadas, caracterização estrutural dos elementos clonados (íntrons, éxons, TIRs, etc.), caracterização das regiões flanqueadoras, avaliação do número de cópias, identificação da contribuição dos parentais do híbrido, e o estudo da expressão dos elementos. (AU)