Historia demografica de erv-k em humanos, chimpanzes e macacos rhesus.

• Processo: 07/07252-4
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2007
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2008
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
• Pesquisador responsável: Paolo Marinho de Andrade Zanotto
• Beneficiário: Paolo Marinho de Andrade Zanotto
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Retroviridae Evolução molecular Primatas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Erv-K | evolução molecular | Primatas | retrovirus | Evolução Molecular de Microorganismos

Resumo

Neste trabalho foram detectados 19 genomas completos de retrovírus endógenos da família K no genoma de macaco Rhesus (Macaca mulatta; RhERV-K) e 12 no genoma de chimpanzé (Pan troglodytes; CERV-K). Estas sequências foram comparadas com 55 sequências de ERV-K humanos (HERV-K) e 20 de CERV-K previamente descritas, produzindo um banco de dados com 106 genomas completos de ERV-K. Dentre os elementos avaliados 61% dos HERV-K, 21% dos CERV-K e 47% dos RhERV-K apresentaram tempo de integração menor que 4,5 milhões de anos. A média de integração foi 7.8 Milhões de anos atrás para HERV-K, 13,4 e 10,3 milhões de anos atrás para CERV-K e RhERV-K respectivamente. Excluindo-se as sequências originadas por duplicação cromossômica, foram utilizadas 63 dos 106 elementos iniciais para a comparação da dinâmica populacional de ERV-K nos diferentes primatas. Estas análises indicaram que ambos HERV-k e RhERV-K apresentaram histórias demográficas similares, incluindo o pequeno tamanho efetivo de população, em comparação com CERV-K. Provavelmente estas discrepâncias na dinâmica entre os grupos de ERV-K reflitam diferenças ecológicas e evolutivas entre os hospedeiros. (AU)