Modelos computacionais para famílias de proteínas relevantes em bioenergia microbiana

• Processo: 11/23296-7
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2012
• Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2014
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Bioquímica de Microorganismos
• Pesquisador responsável: João Carlos Setubal
• Beneficiário: João Carlos Setubal
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Claudia Barros Monteiro Vitorello
• Assunto(s): Proteínas Bioenergética
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioenergia | familias genicas | modelos de Markov | Procariotos | transferencia automatica de anotação | modelos de Markov para familias genicas

Resumo

Este projeto tem por objetivo gerar Modelos Ocultos de Markov, ou HMMs, para famílias de proteínas microbianas derelevância em bioenergia. Tais modelos permitirão propagação automática de anotações manuais dos genes que codificamessas proteínas. O projeto está associado a um outro projeto que está sendo realizado nos E.U.A. o qual tem porobjetivo criar novos termos da Gene Ontology (GO) para funções, processos e componentes relacionados a bioenergia de base microbiana, bem como anotar manualmente uma coleção de proteínas de genomas específicos com os novos termos. A propagação automática dessas anotações por meio de nossos HMMs iá potencializar a utilidade dos novos termos GOque estão sendo criados. (AU)