AbEvo - (Antibodies Evolution): sistema inteligente para o desenvolvimento de anticorpos baseado na estrutura do antígeno

• Processo: 04/08297-3
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas - PIPE
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2005
• Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2008
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Imunologia - Imunologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Oscar Henrique Pereira Ramos
• Beneficiário: Oscar Henrique Pereira Ramos
• Empresa: Cientistas Associados Desenvolvimento Tecnológico Ltda
• Município: São Carlos
• Bolsa(s) vinculada(s): 06/60257-1 - Abevo - (antibodies evolutivo): sistema inteligente para o desenvolvimento de anticorpos baseado na estrutura do antígeno, BP.TT; 06/60258-8 - Abevo - (antibodies evolution): sistema inteligente para o desenvolvimento de anticorpos baseado na estrutura do antígeno, BP.TT; 06/60582-0 - Abevo - (antibodies evolution): sistema inteligente para o desenvolvimento de anticorpos baseado na estrutura do antígeno, BP.TT; + mais bolsas vinculadas 06/57892-7 - AbEvo (Antibodies Evolution): sistema inteligente para o desenho de anticorpos baseado na estrutura do antígeno, BP.PIPE; 05/56561-4 - Abevo - (antibodies evolution): sistema inteligente para o desenvolvimento de anticorpos baseado na estrutura do antígeno, BP.TT; 05/53921-0 - Abevo - (antibodies evolution): sistema inteligente para o desenvolvimento de anticorpos baseado na estrutura do antígeno, BP.TT; 05/54723-7 - Abevo - (antibodies evolution): sistema inteligente para o desenvolvimento de anticorpos baseado na estrutura do antígeno, BP.TT; 05/55689-7 - AbEvo (Antibodies Evolution) sistema inteligente para o desenvolvimento de anticorpos baseado na estrutura do antígeno, BP.PIPE - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Modelagem molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Algoritimos Evolutivos | Bioinformatica | Docking Proteina-Proteina | Modelagem Lolecular

Resumo

Este projeto propõe a criação de uma ferramenta computacional para o desenvolvimento e otimização de anticorpos (AbEvo) dirigida pela estrutura de um dado antígeno (evolução in silício). Inspirada nos bem-sucedidos programas delineados para o planejamento de fármacos, a ferramenta visa à redução de custos, de tempo de desenvolvimento e facilitar o escalonamento da produção de anticorpos. Em sua primeira fase, o projeto prevê o desenvolvimento e pré-validação da ferramenta que, numa segunda etapa, deverá ser aperfeiçoada e validada. Entre as vantagens esperadas dos anticorpos concebidos a partir dessa metodologia, destaca-se a prevenção de reações de hipersensibilidade em decorrência da redução estrutural proveniente da utilização de anticorpos de cadeia única (scFVs). Outra vantagem é que a concepção da ferramenta proposta é perfeitamente adequada à expressão dos anticorpos em sistemas bacterianos, o que, conseqüentemente, deverá reduzir o tempo e o custo de produção. A ferramenta também pode ser útil para a otimização de anticorpos, diminuindo a ocorrência de reconhecimentos moleculares inespecíficos por meio do aperfeiçoamento de interações moleculares. Entre as possibilidades comerciais prospectadas a partir da AbEvo incluem-se biofármacos, marcadores para diagnóstico por imagem e desenvolvimento de kits de diagnóstico, entre vários outros. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

OZAKI, CHRISTIANE Y.; SILVEIRA, CAIO R. F.; ANDRADE, FERNANDA B.; NEPOMUCENO, ROBERTO; SILVA, ANDERSON; MUNHOZ, DANIELLE D.; YAMAMOTO, BRUNO B.; LUZ, DANIELA; ABREU, PATRICIA A. E.; HORTON, DENISE S. P. Q.; et al. Single Chain Variable Fragments Produced in Escherichia coli against Heat-Labile and Heat-Stable Toxins from Enterotoxigenic E-coli. PLoS One, v. 10, n. 7, JUL 8 2015. (11/12928-2, 10/14659-6, 06/60258-8, 11/22108-2, 11/24111-0, 04/08297-3)

CASTRO, J. M. A.; OLIVEIRA, T. S.; SILVEIRA, C. R. F.; CAPORRINO, M. C.; RODRIGUEZ, D.; MOURA-DA-SILVA, A. M.; RAMOS, O. H. P.; RUCAVADO, A.; GUTIERREZ, J. M.; MAGALHAES, G. S.; et al. A neutralizing recombinant single chain antibody, scFv, against BaP1, A P-I hemorrhagic metalloproteinase from Bothrops asper snake venom. Toxicon, v. 87, p. 81-91, SEP 2014. (12/01028-3, 04/08297-3)