Interações proteína-proteína e proteína-membrana: estudos por simulação molecular

• Processo: 05/01151-6
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2006
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2008
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Química - Físico-química
• Pesquisador responsável: Leo Degreve
• Beneficiário: Leo Degreve
• Instituição Sede: Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Termodinâmica Simulação de dinâmica molecular Proteínas Peptídeos Membrana celular Liberação de vírus HIV-1
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Atividade De Proteinas | Brotamento Do Virus Hiv-1 | Peptideos Antimicrobianos | Simulacao Molecular | mecânica estatística, biofísica

Resumo

As proteínas, que são as macromoléculas mais abundantes nas células vivas, possuem uma grande diversidade de funções biológicas, podendo ser classificadas como enzimas, proteínas transportadoras, proteínas nutrientes e de armazenamento, proteínas contráteis, proteínas estruturais, proteínas de defesa, proteínas reguladoras e com outras funções mais específicas que podem ser encontradas em determinadas células mais especializadas. Para um bom entendimento das funções biológicas das proteínas é necessário conhecer sua estrutura tridimensional e suas interações com outras proteínas e com membranas celulares. As membranas biológicas, essenciais para a vida, formam as barreiras semi-permeáveis e especializadas das células e de organelas celulares em que seus principais constituintes estruturais (lipídeos e proteínas de membrana) facilitam processos básicos de respiração, fotossíntese, transporte de proteínas e outros solutos, transdução de sinal e mobilidade. As membranas celulares possuem uma estrutura geral comum constituída, principalmente, por uma bicamada lipídica estruturalmente mantida por várias interações não covalentes que podem levar, ou não, à formação de ligações de hidrogênio intra e/ou intermoleculares juntamente com as interações com o meio aquoso. A constituição das bicamadas lipídicas de seres uni e multicelulares resulta em diferentes cargas líquidas nas faces externas nas bicamadas lipídicas de bactérias e de células de organismos multicelulares é a chave principal da seletividade dos peptídeos antimicrobianos uma vez que as cargas na face externa das membranas celulares são bastante diferentes ao considerar organismos unicelulares e multicelulares. As interações específicas entre proteínas tem um importante papel em muitas atividades celulares tais como transdução de sinal, regulação de processos bioquímicos, resposta imunológica, e muitas outras... (AU)