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Transcriptome profile of Trichoderma harzianum IOC-3844 induced by sugarcane bagasse

Processo: 14/01786-0
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
Vigência: 01 de março de 2014 - 31 de agosto de 2014
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia
Pesquisador responsável:Anete Pereira de Souza
Beneficiário:Anete Pereira de Souza
Instituição-sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Assunto(s):Trichoderma harzianum  Celulase  Transcriptoma  Bagaço de cana-de-açúcar  Etanol 

Resumo

Analisar o perfil do transcriptoma que em funcionamento durante a degradação da biomassa pelo fungo Trichoderma harzianum permite a identificação de sequências de genes com potencial aplicação no tratamento de hidrólise enzimática. No presente estudo, o transcriptoma de T. harzianum IOC-3844 foi analisado utilizando a tecnologia de RNA-seq. O sequenciamento gerou 14,7 GPb para as análises . a análise das sequwncias "De novo Assembly" resultou em 32.396 contigs , que foram submetidos à identificação e classificados de acordo com suas identidades. Esta análise permitiu definir um conjunto principal de genes de Trichoderma harzianum que está envolvido na degradação da celulose e hemicelulose, e os genes acessórios que estão envolvidos na despolimerização da biomassa. A análise adicional dos níveis de expressão identificou um conjunto de enzimas carboidrato-ativa que são reguladas positivamente em diferentes condições. O presente estudo proporciona informação valiosa para estudos futuros de degradação da biomassa e contribui para uma melhor compreensão do papel dos genes que estão envolvidos neste processo. (AU)

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