| Processo: | 15/17889-6 |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Regular |
| Data de Início da vigência: | 01 de dezembro de 2015 |
| Data de Término da vigência: | 30 de novembro de 2017 |
| Área do conhecimento: | Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos |
| Pesquisador responsável: | Paulo Eduardo Brandão |
| Beneficiário: | Paulo Eduardo Brandão |
| Instituição Sede: | Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FMVZ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil |
| Pesquisadores associados: | Karin Corrêa Scheffer Ferreira ; Rafael de Novaes Oliveira |
| Assunto(s): | Virologia Infecções por Coronavirus Gammacoronavirus Códon Filogenia molecular Evolução molecular Mamíferos Aves Interações entre hospedeiro e microrganismos |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Aves | Coronavirinae | Evolução | Mamíferos | utilização de códons | Virologia |
Resumo
Coronavírus (Nidovirales: Coronaviridae: Coronavirinae) utilizam uma ampla diversidade de hospedeiros mamíferos e aviários, tendo evoluído com ancestrais dos mesmos há pelo menos 293 milhões de anos, levando a diversos tipos de relação vírus-hospedeiros como processos patológicos de trato respiratório, reprodutivo, entérico e urinário, ou infecção assintomática como em Quirópteros, estes últimos sendo alvo das mais recentes pesquisas evolutivas e epidemiológicas em coronavírus. A co-evolução do sistema coronavírus-hospedeiros é amplamente conhecida em termos de filogenia, genética de populações em quase-espécies e em termos de patogenia celular, resposta imune, receptores e transmissão, mas estudos baseados em utilização de codons são extremamente escassos. Neste sentido, os objetivos deste Projeto de Pesquisa são medir a utilização de códons para genes de proteínas não-estruturais e estruturais de espécies de coronavírus em relação aquela encontrada em diversos sítios de replicação dos mesmos em hospedeiros mamíferos e aviários, definir as forças evolutivas que moldam a utilização de códons em Coronavirinae e estudar de modo comparado os regimes de seleção em Coronavirinae tendo como unidades de seleção tanto códons quanto nucleotídeos. Pretende-se com isto contribuir para o aprofundamento no entendimento da co-evolução molecular coronavírus-hospedeiros, permitindo a predição de adaptação de novos coronavírus a diferentes hospedeiros, bem como validar métodos de filogenia molecular baseada em códons para aplicação em outros sistemas vírus-hospedeiros. (AU)
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