Understanding the role of the master regulator XYR1 in Trichoderma reesei by global transcriptional analysis

• Processo: 16/01226-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2016
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2016
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
• Pesquisador responsável: Roberto do Nascimento Silva
• Beneficiário: Roberto do Nascimento Silva
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Análise de sequência de RNA Enzimas Expressão gênica Trichoderma reesei
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: enzymes | gene expression | RNA-seq | Trichoderma reesei | Xyr1 Tf | biologia Molecular de fungos

Resumo

Definiu-se o papel do factor de transcrição - XYR1 - no fungo filamentoso Trichoderma reesei durante a degradação do material celulósico. A este respeito, foi realizada uma análise de transcriptoma global usando RNA-Seq da linhagem mutante de T. reesei ”xyr1 comparando com parental 9414 QM cultivadas na presença de celulose, soforose, e glucose como única fonte de carbono. Descobrimos que 5885 genes diferencialmente expressos no âmbito das três fontes de carbono testadas. Destes, 322 genes foram sobre-regulada na presença de celulose, enquanto 367 e 188 foram regulados positivamente em soforose e glucose, respectivamente. Com relação aos genes sob a regulação direta de XYR1, 30 e 33 são exclusivos para celulose e soforose, respectivamente. Os genes mais modulados no ”xyr1 pertencem a carboidratos-ativos enzimas (CAZymes), fatores de transcrição, e transportadores famílias. Além disso, destaca-se a regulação baixa dos transportadores pertencentes às famílias de transportadores MFS e ABC. Destes, os membros MFS foram principalmente regulada negativamente na presença de celulose. Em soforose e glicose, a expressão destes transportadores foi principalmente regulada positivamente. Nossos resultados revelaram que transportadores do tipo MFS e ABC poderiam ser os novos componentes na degradação da celulose e que seu papel mostrou ser fonte dependente do carbono. Nossas descobertas vao contribuir para uma melhor compreensão dos mecanismos de regulação de XYR1 para controlar a expressão génica em T. reesei da celulase na presença de material celulósico, aumentando assim potencialmente a sua aplicação em vários campos da biotecnologia. (AU)