Genetic structure and molecular variability analysis of citrus sudden death-associated virus isolates from plants affected by citrus sudden death in Brazil reveals a genetic clade associated with citrus disease.

• Processo: 16/25016-5
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2017
• Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2017
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitossanidade
• Pesquisador responsável: Marcos Antonio Machado
• Beneficiário: Marcos Antonio Machado
• Instituição Sede: Instituto Agronômico (IAC). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Filogenia Virologia molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Citrurs sudden death associated virus | Citrus tristeza virus | Filogenia | Novos virus em citros | Virologia molecular

Resumo

O vírus associado à morte súbita dos citros (CSDaV) é um vírus de RNA fita sense positivo e foi sugerido estar associado à morte súbita dos citros (MSC) no Brasil. Aqui, nós reportamos o primeiro estudo da estrutura genética e variabilidade molecular entre 31 isolados de CSDaV coletados tanto em plantas sintomáticas quanto em plantas assintomáticas, em áreas afetadas por morte súbita. Análise de sequência parcial de nucleotídeos de cinco domínios do RNA genômico de CSDaV, helicase, RNA polimerase dependente de RNA e capa proteica, mostraram que a região codificadora MDR foi a mais diversa e uma possível associação entre esta região e a capacidade de adapatação do vírus a diferentes hospedeiros foi discutida. De modo geral, a diversidade nucleotídica (À) foi menor para isolados de CSDaV, mas a análise filogenética revela a predominância de dois grupos de isolados, um dos quais mostrou maior associação com plantas sintomáticas. Isolados de plantas sintomáticas comparados àqueles de plantas assintomáticas mostraram maior diversidade nucleotídica, substituições não sinônimas e mudanças no número de aminoácidos na região codificadora próxima à região 5'e a região genômica do RNA. Este trabalho demonstra novas informações para o estudo de diversidade de CSDaV, dando suporte para outros estudos de epidemiologia. (AU)