Deep Sequencing Analysis of RNAs from Citrus Plants Grown in a Citrus Sudden Death-affected Area Reveals Diverse Known and Putative Novel Viruses

• Processo: 17/10810-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2017
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2017
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitossanidade
• Pesquisador responsável: Marcos Antonio Machado
• Beneficiário: Marcos Antonio Machado
• Instituição Sede: Instituto Agronômico (IAC). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Sequenciamento de nova geração Virologia molecular Morte súbita dos citros
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Morte Subita dos Citros | Novos virus em citros | sequenciamento de nova geração | Viroses de citros | Virologia molecular

Resumo

A morte súbita de cítricos (CSD) causou a morte de aproximadamente quatro milhões de laranjeiras em uma região muito importante no Brasil. Embora sua etiologia ainda não esteja completamente clara, os sintomas e sua distribuição das plantas afetadas indicam uma doença viral. Numa pesquisa de vírus associados à CSD, realizou-se uma análise comparativa de sequenciação de alto rendimento do transcriptoma e pequenos RNAs de plantas sintomáticas e assintomáticas com morte súbita utilizando a plataforma Illumina. Os dados revelaram infecções mistas que incluíram o vírus Citrus tristeza (CTV) como o vírus mais predominante, seguido pelo vírus associado à morte súbita de Citrus (CSDaV), pararetrovirus endógeno de Citrus (CitPRV) e dois novos vírus putativos denominados Citrus jingmen-like virus (CJLV) e vírus Citrus virga-like (CVLV). As análises de sequenciamento foram sensíveis o suficiente para diferenciar dois genótipos de ambos os vírus anteriormente associados com plantas afetadas pela CSD: CTV e CSDaV. Nossos dados também mostraram uma associação das plantas sintomáticas de CSD com um genótipo específico de CSDaV e uma provável associação com CitPRV também, enquanto que os dois novos vírus putativos mostraram estar mais associados com plantas assintomáticas. Este é o primeiro estudo baseado em sequenciamento de alto rendimento das sequências virais presentes em plantas cítricas afetadas pela morte e gerou informações valiosas para estudos adicionais de CSD. (AU)