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Deep Sequencing Analysis of RNAs from Citrus Plants Grown in a Citrus Sudden Death-affected Area Reveals Diverse Known and Putative Novel Viruses

Resumo

A morte súbita de cítricos (CSD) causou a morte de aproximadamente quatro milhões de laranjeiras em uma região muito importante no Brasil. Embora sua etiologia ainda não esteja completamente clara, os sintomas e sua distribuição das plantas afetadas indicam uma doença viral. Numa pesquisa de vírus associados à CSD, realizou-se uma análise comparativa de sequenciação de alto rendimento do transcriptoma e pequenos RNAs de plantas sintomáticas e assintomáticas com morte súbita utilizando a plataforma Illumina. Os dados revelaram infecções mistas que incluíram o vírus Citrus tristeza (CTV) como o vírus mais predominante, seguido pelo vírus associado à morte súbita de Citrus (CSDaV), pararetrovirus endógeno de Citrus (CitPRV) e dois novos vírus putativos denominados Citrus jingmen-like virus (CJLV) e vírus Citrus virga-like (CVLV). As análises de sequenciamento foram sensíveis o suficiente para diferenciar dois genótipos de ambos os vírus anteriormente associados com plantas afetadas pela CSD: CTV e CSDaV. Nossos dados também mostraram uma associação das plantas sintomáticas de CSD com um genótipo específico de CSDaV e uma provável associação com CitPRV também, enquanto que os dois novos vírus putativos mostraram estar mais associados com plantas assintomáticas. Este é o primeiro estudo baseado em sequenciamento de alto rendimento das sequências virais presentes em plantas cítricas afetadas pela morte e gerou informações valiosas para estudos adicionais de CSD. (AU)