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Avaliação genômica em populações comerciais de bovinos de corte utilizando dados reais e simulados

Processo: 16/22751-6
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de junho de 2017 - 31 de maio de 2019
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Fernando Sebastián Baldi Rey
Beneficiário:Fernando Sebastián Baldi Rey
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
Pesq. associados: Daniela Andressa Lino Lourenco ; Danísio Prado Munari ; Ignacio Aguilar ; Rafael Lara Tonussi ; Rafael Medeiros de Oliveira Silva ; Raysildo Barbosa Lôbo
Assunto(s):Marcadores genéticos  Bovinos de corte 

Resumo

O objetivo deste projeto é avaliar o impacto da aplicação de informações genômicas em situações de incerteza de paternidade e diferentes estratégias de genotipagem sobre as avaliações genéticas em rebanhos de bovinos de corte utilizando dados reais e simulados. Neste estudo, um rebanho bovino comercial será simulado considerando diferente proporção de animais jovens genotipados com touros e avôs maternos desconhecidos. Além disso, uma população de bovinos de corte pertencentes a um programa de melhoramento com registros fenotípicos, pedigree completo e informação genômica será simulada. A principal idéia é através dos animais jovens genotipados rapidamente estabelecer ligações genéticas de forma mais rápida com as informações genômicas (matriz G) entre a população de gado de corte comercial e a população programa de melhoramento. Para avaliar a aplicação dos métodos BLUP e ssGBLUP (single step genomic BLUP) em populações comerciais de bovinos de corte (PCBC) com diferentes estruturas populacionais e diferentes estratégias de genotipagem será criada uma matriz A com diferentes proporções de animais jovens (bezerros) com touros desconhecidos (25, 50 e 75%) e matrizes com pais desconhecidos (0, 25, 50, 75 e 100%). Nesta população, os bezerros das ultimas 3 gerações serão genotipados numa proporção de 25, 50, 75 e 100% dos animais. A simulação será executada para dois características com baixa herdabilidade (0,12) como stayability e moderada (0,34) como peso ao sobreano. Para o estudo com os dados reais, serão utilizados registros para as características stayability e peso ao sobreano de animais da raça Nelore, pertencentes ao programa de Melhoramento Genético da Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP), programa Nelore Brasil. Para as características estudadas há um banco de dados disponível com aproximadamente 11.000 animais com informações genotípicas, 30.000 e 60.000 observações fenotípicas para STAY e PS, respectivamente. Serão utilizadas informações de 18 fazendas localizadas nas regiões Sudeste, Centro-oeste e Norte do Brasil, e que integram o programa de melhoramento genético Nelore Brasil (Nelore). Os resultados do presente projeto irão permitir: 1) Avaliar o impacto do uso da informação genômica em rebanhos de gado de corte comerciais com diferente estrutura populacional; 2) Verificar a proporção de animais genotipados jovens necessárias para obter avaliações genéticas confiáveis em rebanhos bovinos de corte comerciais; 3) Avaliar a viabilidade técnica e económica das avaliações genômicas usando o ssGBLUP em rebanhos bovinos de corte comerciais; 4) Formar e consolidar uma equipe de trabalho no âmbito nacional e internacional, constituído por diferentes especialistas de reconhecida trajetória, esta equipe deverá formar uma plataforma sólida para a concreção de futuros projetos de pesquisa; 5) Implementar metodologias estatísticas para a utilização de dados genômicos no melhoramento animal. A informação gerada neste projeto será amplamente difundida a nível regional, nacional e internacional, a través de diferentes estratégias (apresentações em congressos nacionais e internacionais, artigos técnicos e científicos, resumos, etc.), atendendo aos diferentes públicos (alunos, técnicos, criadores). Neste processo será contemplado vários agentes da cadeia da carne, desde o pecuarista, pesquisadores, técnicos, alunos de pós-graduação, centrais de inseminação e indústria. Este projeto permitirá delinear estratégias e ferramentas que auxiliarão no melhoramento genético de rebanhos comerciais para várias características que influenciam a rentabilidade dos sistemas de gado de corte. Os resultados deste projeto auxiliarão no delineamento de estratégias utilizando informações genômicas que permitirão identificar de forma mais confiável e mais rapidamente animais geneticamente superiores em rebanhos comerciais. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
KLUSKA, SABRINA; OLIVIERI, BIANCA FERREIRA; BONAMY, MARTIN; JUSTIN CHIAIA, HERMENEGILDO LUCAS; BRAGA FEITOSA, FABIELI LOISE; BERTON, MARIANA PIATTO; PERIPOLLI, ELISA; ANTUNES LEMOS, MARCOS VINICLUS; TONUSSI, RAFAEL LARA; LOBO, RAYSILDO BARBOSA; MAGNABOSCO, CLAUDIO DE ULHOA; DI CROCE, FERNANDO; OSTERSTOCK, JASON; CRAVO PEREIRA, ANGELICA SIMONE; MUNARI, DANISIO PRADO; BEZERRA, LUIZ ANTONIO; LOPES, FERNANDO BRITO; BALDI, FERNANDO. Estimates of genetic parameters for growth, reproductive, and carcass traits in Nelore cattle using the single step genomic BLUP procedure. LIVESTOCK SCIENCE, v. 216, p. 203-209, OCT 2018. Citações Web of Science: 2.

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