Isolamento de bactérias incultiváveis da Antártica usando longos períodos de incubação e meios oligotróficos (Isolation of uncultured bacteria from Antarctica using long incubation periods and low nutritional media)

• Processo: 17/15818-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2017
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2018
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia
• Pesquisador responsável: Fabio Rodrigues
• Beneficiário: Fabio Rodrigues
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Antártica Microbiologia ambiental
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Antártica | Incultiváveis | Microbiologia | Oligotrófico | Microbiologia ambiental

Resumo

Os microrganismos não cultivados compreendem a maior parte da diversidade microbiana existente em nosso planeta. Apesar dos avanços em sequenciamento ambiental e genômica de célula única, estudos em profundidade sobre metabolismo bacteriano e rastreio de novos bioprodutos só podem ser avaliados pela cultura de micróbios no laboratório. Aqui, relatamos microrganismos não cultivados ou recalcitrantes de uma amostra de solo antártico, utilizando métodos relativamente simples: meios oligotróficos, períodos de incubação prolongados, observação sob estereomicroscopia e seleção de bactérias de crescimento lento. Conseguimos isolar vários microrganismos raros pertencentes a gêneros raramente isolados ou descritos recentemente, por exemplo Lapillicoccus, Flavitalea, Quadrisphaera, Motilibacter e Polymorphobacter. Além disso, obtivemos isolados apresentando similaridade de sequências de rRNA 16S variando de 92,08% a 94,46% com qualquer outra espécie de cultura conhecida, incluindo dois isolados distintos da classe Thermoleophilia, que, embora comum em solos antárticos (conforme identificado pela metagenômica), nunca foi relatado isolado de tais amostras. Nossos dados indicam que métodos simples ainda são úteis para o cultivo de microrganismos recalcitrantes, mesmo quando se trata de amostras de ambientes extremos. (AU)