O sistema mutator em cana-de-açúcar: uma análise comparativa com arroz

• Processo: 05/58770-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2006
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2007
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Maria Magdalena Rossi
• Beneficiário: Nilo Luiz Saccaro Junior
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 04/02851-9 - Elementos de transposição e seu impacto no genoma de bactérias e plantas, AP.TEM
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Arroz | Cana-De-Acucar | Clonagem | Mutator | Transposase | Transposons

Resumo

Os elementos transponíveis (TEs) constituem grande parte do material genético de diversos eucariotos variando entre 50-80% do genoma de algumas gramíneas. Os projetos genoma proporcionaram um aumento das informações disponíveis sobre estes elementos, o que evidenciou sua importância e possibilitou o desenvolvimento de novas abordagens para seu estudo. No banco de dados do SUCEST, foi encontrado um abundante espectro de TEs sendo expressos, sendo Mutator o transposon mais freqüente. Este elemento foi originalmente descrito em milho, onde é um agente altamente eficaz para a criação de mutações de novo, sendo utilizado para a identificação de genes através de "transposon tagging". Este projeto tem como objetivo aprofundar o conhecimento sobre o sistema Mutator em cana-de-açúcar a partir da análise comparativa entre seqüências dessa planta e de arroz (cujo genoma já foi seqüenciado). Para isso será realizado o seqüenciamento e a anotação de porções do genoma de cana que possuam seqüências relacionadas ao elemento. Por outro lado, serão caracterizados os elementos Mutator de arroz. Estudos comparativos sobre sua distribuição e estrutura nos genomas das duas plantas contribuirão para a compreensão da co-evolução entre um transposon e seu genoma hospedeiro. A comparação entre regiões cromossômicas correspondentes em arroz e em cana fornecerá evidências para a verificação da hipótese de que grandes diferenças no tamanho do genoma de espécies próximas podem ser devidas ao acúmulo de TEs. (AU)