Correlacao entre a expressao dos fatores de splicing e a ocorrencia de especificos padroes de splicing alternativo em homo sapiens e mus musculus.

• Processo: 06/54834-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2006
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2008
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Sandro José de Souza
• Beneficiário: Julio Cesar Nunes
• Instituição Sede: Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer (ILPC). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Genômica comparativa
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioinformatica | Genomica Comparativa | Splicing Alternativa

Resumo

O splicing alternativo possui considerável importância no incremento da complexidade genômica e protéica, com a produção de um extenso número de mRNAs e isoformas protéicas. Estimando-se que aproximadamente de 40% a 60% dos genes humanos sofram splicing alternativo, o que torna o evento mais uma regra do que exceção. Avanços experimentais in silico indicam que amostras derivadas de tumores freqüentemente demonstram modelos diferenciais de splicing, sugerindo que um padrão de alterações do splicing poderia ser difundido em neoplasias humanas. As interações entre os fatores de splicing e elementos auxiliares cis-acting, modulam a associação do spliceossomo com o Pré-mRNA, constituindo-se num modo de controle, do splicing alternativo. Neste projeto apregoa-se uma análise investigativa da expressão gênica dos fatores de splicing em bancos de dados de MPSS, contendo bibliotecas de Homo sapiens e Mus musculus, com amostras teciduais de origem normal e neoplásica. Mediante subseqüente seleção dos genes que apresentem variantes de splicing, através do acesso ao conjunto total de seqüências de mRNA e EST em cDNAs encontrados nos genomas das distintas espécies. Tais estratégias possuem amplo referencial de estudo no Laboratório de Biologia Computacional do Instituto Ludwig de Pesquisa em Câncer - São Paulo, cujos trabalhos serão evidenciados, e incorporados ao objetivo de uma análise funcional às correlações resultantes entre a expressão dos fatores de splicing e os padrões de ocorrências dos modos de splicing alternativos nas espécies Homo sapiens e mus musculus. (AU)