O sistema Mutator em cana-de-açúcar: uma análise comparativa com arroz

• Processo: 07/54162-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2007
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2007
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Maria Magdalena Rossi
• Beneficiário: Nilo Luiz Saccaro Junior
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 03/08890-3 - Caracterização genômica e funcional de transposons mutator em cana-de-açúcar, AP.JP
• Assunto(s): Arroz Cana-de-açúcar Clonagem Estudo comparativo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Arroz | Cana De Acucar | Clonagem | Mutator | Transponsons | Transposase

Resumo

Os elementos transponíveis (TEs) constituem grande parte do material genético de diversos eucariotos variando entre 50-80% do genoma de algumas gramíneas. Os projetos genoma proporcionaram um aumento das informações disponíveis sobre estes elementos, o que evidenciou sua importância e possibilitou o desenvolvimento de novas abordagens para seu estudo. No banco de dados do SUCEST, foi encontrado um abundante espectro de TEs sendo expressos, sendo Mutator o transposon mais frequente. Este elemento foi originalmente descrito em milho, onde é um agente altamente eficaz para a criação de mutações de novo, sendo utilizado para a identificação de genes através de "transposon tagging". Este projeto tem como objetivo aprofundar o conhecimento sobre o sistema Mutator em cana-de-açúcar a partir da análise comparativa entre sequências dessa planta e de arroz (cujo genoma já foi sequenciado). Para isso será realizado o sequenciamento e a anotação de porções do genoma de cana que possuam sequências relacionadas ao elemento. Por outro lado, serão caracterizados os elementos Mutator de arroz. Estudos comparativos sobre sua distribuição e estrutura nos genomas das duas plantas contribuirão para a compreensão da co-evolução entre um transposon e seu genoma hospedeiro. A comparação entre regiões cromossômicas correspondentes em arroz e em cana fornecerá evidências para a verificação da hipótese de que grandes diferenças no tamanho do genoma de espécies próximas podem ser devidas ao acúmulo de TEs. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

SACCARO JUNIOR, Nilo Luiz. O sistema Mutator em cana-de-açúcar: uma análise comparativa com arroz. 2007. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Biociências (IBIOC/SB) São Paulo.