Diversidade genética de cará-do-ar (Dioscorea bulbifera) originários de roças de agricultura tradicional por meio de marcadores microssatélites

• Processo: 10/04655-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2010
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2011
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Elizabeth Ann Veasey
• Beneficiário: Danielle Muniz da Silva
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Diversidade genética Repetições de microssatélites Genética ecológica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: agricultura tradicional | desenvolvimento de primers | Dioscorea bulbifera | Diversidade Genética | etnovariedades | Microssatélites | Genética Ecológica

Resumo

Este estudo tem por objetivo caracterizar, por marcadores microssatélites, a diversidade genética de etnovariedades pertencentes ao banco de germoplasma ex situ de Dioscorea bulbifera da Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz", originárias de roças de agricultura tradicional do Vale do Ribeira, SP, do litoral norte do Estado de São Paulo, bem como de alguns municípios dos Estados de Santa Catarina, Paraná, Minas Gerais, Goiás, Piauí, Pernambuco e Amazonas. Para a extração do DNA será utilizado o método de Sharma et al. (2008), baseado no tampão de extração CTAB, com modificações. Serão testadas as condições de amplificação e revelação de 17 iniciadores inespecíficos de microssatélites para a avaliação de acessos desta espécie, além de serem também desenvolvidos iniciadores específicos para espécie. Para a caracterização da diversidade genética, serão obtidos os parâmetros porcentagem de locos polimórficos, número de alelos (bandas) por loco, e o conteúdo de informação de polimorfismo (PIC) dos locos avaliados. Por serem consideradas espécies poliplóides, os dados serão avaliados como presença ou ausência de bandas, como se fosse um marcador dominante e assim submetidos a análises multivariadas, como análises de agrupamento, utilizando o coeficiente de Jaccard e o método aglomerativo UPGMA, a partir do software NTSYS-pc, e análise de coordenadas principais, pelo software PAST. Para verificar como a diversidade genética encontra-se distribuída entre e dentro das regiões amostradas, bem como entre e dentro de comunidades tradicionais dentro de cada região, será realizada uma análise de variância molecular (AMOVA), utilizando o programa Arlequin.

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

SILVA, Danielle Muniz da. Diversidade genética de cará-do-ar (Dioscorea bulbifera L.) originários de roças de agricultura tradicional por meio de marcadores microssatélites. 2013. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.