Aplicação de Métodos Computacionais para Estudo das Interações Intermoleculares entre Aminoácidos e Inibidores não Nucleosídeos da Transcriptase Reversa do Vírus HIV-1

• Processo: 10/19688-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2011
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2015
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Química - Físico-química
• Pesquisador responsável: Sergio Emanuel Galembeck
• Beneficiário: Leandro Ribeiro
• Instituição Sede: Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): AIDS HIV-1 Ligações de hidrogênio
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Aids | Hiv-1 | ligacoes de hidrogenio | stacking | Química Quântica Computacional

Resumo

O presente projeto de pesquisa, "Aplicação de Métodos Computacionais para Estudo e Caracterização das Interações Intermoleculares entre Aminoácidos e Inibidores não Nucleosídeos da Transcriptase Reversa do Vírus HIV-1", é dedicado ao estudo químico-quântico da análise das alterações da densidade eletrônica nas interações entre aminoácidos do bolso alostéricos e alguns inibidores da transcriptase reversa isolada e quando ligadas a diferentes inibidores.O modelo utilizado nesse estudo são estruturas dos complexos de inibidores não nucleosídeos da transcriptase reversa (NNRTI) obtidas do Protein Data Banking (PDB), referentes a primeira e segunda geração desses inibidores. Além da importância detalhada dos mecanismos de ação desses inibidores, como mudanças de conformação das cadeias da enzima e às mutações pontuais, variação estrutural, etc., o trabalho de pesquisa proposto nesse plano deverá contribuir para o desenvolvimento de técnicas e protocolos que permitam analisar essas interações em uma grande gama de sistemas de proteínas em diferentes moléstias e em outros sistemas de interesse farmacológico.