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Estudo computacional da interação entre inibidores não nucleosídeos da transcriptase reversa do vírus HIV-1 com aminoácidos do sítio inibitório

Processo: 08/02677-0
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de junho de 2010 - 31 de julho de 2012
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Química - Físico-química
Pesquisador responsável:Sergio Emanuel Galembeck
Beneficiário:Sergio Emanuel Galembeck
Instituição-sede: Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Assunto(s):Ligação química  Ligação de hidrogênio  AIDS  Química teórica 

Resumo

O projeto de pesquisa objetiva a análise das interações entre os aminoácidos do sítio inibitório da transcriptase reversa do vírus HIV-1 e alguns dos inibidores não nucleosídeos por métodos de análise da densidade eletrônica e de decomposição da energia. Devem ser abordadas os efeitos das pricipais mutações pontuais, a presença de mais de um aminoácido interagindo com um dado inibidor e o crescimento das cadeias de aminoácidos, além das alterações na tríade catalítica e nos aminoácidos do sítio ativo. (AU)

Publicações científicas (19)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ORENHA, RENATO P.; GALEMBECK, SERGIO E. How does the pH influences the Ru-NO coordination compounds?. International Journal of Quantum Chemistry, v. 119, n. 20 OCT 15 2019. Citações Web of Science: 0.
ORENHA, RENATO P.; CARAMORI, GIOVANNI F.; MISTURINI, ALECHANIA; GALEMBECK, SERGIO E. Shedding light on the electronic structure of [Ru((6)-C16H16)(NH3)(3)](2+) complex: a computational insight. Journal of Molecular Modeling, v. 25, n. 1 JAN 2019. Citações Web of Science: 0.
TEODORO, T. Q.; KOENIS, M. A. J.; RUGER, R.; GALEMBECK, S. E.; BUMA, W. J.; NICU, V. P.; VISSCHER, L. Use of Density Functional Based Tight Binding Methods in Vibrational Circular Dichroism. Journal of Physical Chemistry A, v. 122, n. 49, p. 9435-9445, DEC 13 2018. Citações Web of Science: 0.
TEODORO, T. Q.; KOENIS, M. A. J.; GALEMBECK, S. E.; NICU, V. P.; BUMA, W. J.; VISSCHER, L. Frequency Range Selection Method for Vibrational Spectra. Journal of Physical Chemistry Letters, v. 9, n. 23, p. 6878-6882, DEC 6 2018. Citações Web of Science: 0.
ORENHA, RENATO P.; VESSECCHI, RICARDO; GALEMBECK, SERGIO E. The influence of the negative hyperconjugation is relevant for the analysis of the pi-pi{*} conjugation with the mono-substitution and di-substitution of H2C= by O= and/or HN= in trans-buta-1,3-diene?. STRUCTURAL CHEMISTRY, v. 29, n. 3, p. 847-857, JUN 2018. Citações Web of Science: 3.
ORENHA, RENATO PEREIRA; TFOUNI, ELIA; GALEMBECK, SERGIO EMANUEL. How does the total charge and isomerism influence the Ru-NO ammine complexes?. Physical Chemistry Chemical Physics, v. 20, n. 19, p. 13348-13356, MAY 21 2018. Citações Web of Science: 2.
GALEMBECK, SERGIO E.; CARAMORI, GIOVANNI F.; MISTURINI, ALECHANIA; GARCIA, LEONE C.; ORENHA, RENATO P. Metal-Ligand Bonding Situation in Ruthenophanes Containing Multibridged Cyclophanes. Organometallics, v. 36, n. 18, p. 3465-3470, SEP 25 2017. Citações Web of Science: 7.
BRAIDA, BENOIT; GALEMBECK, SERGIO E.; HIBERTY, PHILIPPE C. Ozone and Other 1,3-Dipoles: Toward a Quantitative Measure of Diradical Character. JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION, v. 13, n. 7, p. 3228-3235, JUL 2017. Citações Web of Science: 8.
DE LIMA BATISTA, ANA P.; DE OLIVEIRA-FILHO, ANTONIO G. S.; GALEMBECK, SERGIO E. CO2 Sequestration by Triazolylidene-Derived N-Heterocyclic Olefins: A Computational Study. CHEMISTRYSELECT, v. 2, n. 17, p. 4648-4654, JUN 12 2017. Citações Web of Science: 5.
DE LIMA BATISTA, ANA P.; DE OLIVEIRA-FILHO, ANTONIO G. S.; GALEMBECK, SERGIO E. Photophysical properties and the NO photorelease mechanism of a ruthenium nitrosyl model complex investigated using the CASSCF-in-DFT embedding approach. Physical Chemistry Chemical Physics, v. 19, n. 21, p. 13860-13867, JUN 7 2017. Citações Web of Science: 11.
ORENHA, RENATO P.; ROCHA, MARCUS V. J.; POATER, JORDI; GALEMBECK, SERGIO E.; BICKELHAUPT, F. MATTHIAS. Nature of the Ru-NO Coordination Bond: Kohn-Sham Molecular Orbital and Energy Decomposition Analysis. CHEMISTRYOPEN, v. 6, n. 3, p. 410-416, JUN 2017. Citações Web of Science: 7.
ORENHA, RENATO PEREIRA; SANTIAGO, REGIS TADEU; ANDRADE HAIDUKE, ROBERTO LUIZ; GALEMBECK, SERGIO EMANUEL. How computational methods and relativistic effects influence the study of chemical reactions involving Ru-NO complexes?. Journal of Computational Chemistry, v. 38, n. 12, p. 883-891, MAY 2017. Citações Web of Science: 10.
DE LIMA BATISTA, ANA PAULA; DE OLIVEIRA-FILHO, ANTONIO G. S.; GALEMBECK, SERGIO EMANUEL. Computationally Designed 1,2,4-Triazolylidene-Derived N-Heterocyclic Olefins for CO2 Capture, Activation, and Storage. ACS OMEGA, v. 2, n. 1, p. 299-307, JAN 2017. Citações Web of Science: 5.
ORENHA, RENATO P.; GREGORIO, LETICIA R. SAN; GALEMBECK, SERGIO E. Computational study of the interaction between NO, NO+, and NO- with H2O. Journal of Molecular Modeling, v. 22, n. 11 NOV 2016. Citações Web of Science: 2.
OLIVIER, DANILO DA SILVA; ITO, AMANDO SIUITI; GALEMBECK, SERGIO EMANUEL. Microhydration effects on geometric properties and electronic absorption spectra of ortho-aminobenzoic acid. SPECTROCHIMICA ACTA PART A-MOLECULAR AND BIOMOLECULAR SPECTROSCOPY, v. 147, p. 328-333, AUG 5 2015. Citações Web of Science: 2.
ORENHA, RENATO PEREIRA; VESSECCHI, RICARDO; GALEMBECK, SERGIO E. The resonance of cation and anion radicals with multiple conjugated bonds. STRUCTURAL CHEMISTRY, v. 26, n. 2, p. 365-373, APR 2015. Citações Web of Science: 5.
GALEMBECK, SERGIO E.; BICKELHAUPT, F. MATTHIAS; GUERRA, CELIA FONSECA; GALEMBECK, EDUARDO. Effects of the protonation state in the interaction of an HIV-1 reverse transcriptase (RT) amino acid, Lys101, and a non nucleoside RT inhibitor, GW420867X. Journal of Molecular Modeling, v. 20, n. 7 JUL 2014. Citações Web of Science: 2.
ORENHA, RENATO P.; GALEMBECK, SERGIO E. Molecular Orbitals of NO, NO+, and NO-: A Computational Quantum Chemistry Experiment. Journal of Chemical Education, v. 91, n. 7, p. 1064-1069, JUL 2014. Citações Web of Science: 3.
PARREIRA, RENATO L. T.; CARAMORI, GIOVANNI F.; MORGON, NELSON H.; GALEMBECK, SERGIO E. Hydrogen bond and the resonance effect on the formamide-water complexes. International Journal of Quantum Chemistry, v. 112, n. 5, p. 1401-1420, MAR 5 2012. Citações Web of Science: 5.

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