Desenvolvimento de novos marcadores baseados em microssatélites para bananeira (musa spp.)

• Processo: 10/01398-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2010
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2011
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia
• Pesquisador responsável: Antonio Vargas de Oliveira Figueira
• Beneficiário: Gabriela de Gaspari Silva
• Instituição Sede: Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 08/03470-0 - Desenvolvimento de novos marcadores baseados em microssatélites para bananeira (Musa spp.), AP.R
• Assunto(s): Diversidade genética Melhoramento genético vegetal Repetições de microssatélites Musa
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Diversidade Genética | Microssatélites | Musa | Melhoramento Vegetal

Resumo

O trabalho será desenvolvido no Laboratório de Melhoramento de Plantas, do Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA/USP), sob a supervisão do Prof. Dr. Antonio Vargas de Oliveira Figueira, como um subprojeto ligado ao Auxílio Pesquisa FAPESP 2008/03470-0. A partir de seqüências contendo microssatélites identificadas em bibliotecas genômicas enriquecidas derivadas do genótipo selvagem 'Calcutta 4' (Musa accuminata subsp. burmaniccoides) e da cultivar diplóide 'Ouro' (Creste et al., 2006), serão projetados oligonucleotídeos específicos para amplificar esses locos. As atividades previstas para o bolsista consistem em avaliar esses iniciadores específicos numa sub-amostra representativa de acessos incluindo as diversas ploidias e composição genômica. Essas análises servirão para estabelecer as condições ótimas de amplificação e avaliar a capacidade dos primers de microssatélite de revelar polimorfismos. Os locos validados serão então re-sintetizados com cauda para marcação fluorescente e empregados na genotipagem de população de mapeamento, atividade essa não vinculada ao presente plano. Além disso, o bolsista irá avaliar a metodologia de marcadores REMAP (Retrotransposon Microsatellite Amplifed Polymorphism) empregando combinações de 6 primers de retrotransposons (Teo et al., 2005) com diversos primers referentes aos locos de microssatélites disponíveis ou os novos validados.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DE JESUS, ONILDO NUNES; DE OLIVEIRA E SILVA, SEBASTIAO; AMORIM, EDSON PERITO; FERREIRA, CLAUDIA FORTES; SALABERT DE CAMPOS, JOSE MARCELLO; SILVA, GABRIELA DE GASPARI; FIGUEIRA, ANTONIO. Genetic diversity and population structure of Musa accessions in ex situ conservation. BMC PLANT BIOLOGY, v. 13, MAR 12 2013. (10/01398-0, 08/03470-0)