Desenvolvimento de novos marcadores baseados em microssatélites para bananeira (musa spp.)

Resumo

O trabalho será desenvolvido no Laboratório de Melhoramento de Plantas, do Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA/USP), sob a supervisão do Prof. Dr. Antonio Vargas de Oliveira Figueira, como um subprojeto ligado ao Auxílio Pesquisa FAPESP 2008/03470-0. A partir de seqüências contendo microssatélites identificadas em bibliotecas genômicas enriquecidas derivadas do genótipo selvagem 'Calcutta 4' (Musa accuminata subsp. burmaniccoides) e da cultivar diplóide 'Ouro' (Creste et al., 2006), serão projetados oligonucleotídeos específicos para amplificar esses locos. As atividades previstas para o bolsista consistem em avaliar esses iniciadores específicos numa sub-amostra representativa de acessos incluindo as diversas ploidias e composição genômica. Essas análises servirão para estabelecer as condições ótimas de amplificação e avaliar a capacidade dos primers de microssatélite de revelar polimorfismos. Os locos validados serão então re-sintetizados com cauda para marcação fluorescente e empregados na genotipagem de população de mapeamento, atividade essa não vinculada ao presente plano. Além disso, o bolsista irá avaliar a metodologia de marcadores REMAP (Retrotransposon Microsatellite Amplifed Polymorphism) empregando combinações de 6 primers de retrotransposons (Teo et al., 2005) com diversos primers referentes aos locos de microssatélites disponíveis ou os novos validados.