Diferentes métodos de extração de DNA associados a diferentes períodos de armazenamento de saliva total para obtenção de DNA genômico para sequenciamento direto

• Processo: 11/22434-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2012
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2013
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Lucimara Teixeira das Neves
• Beneficiário: Thais Francini Garbieri
• Instituição Sede: Faculdade de Odontologia de Bauru (FOB). Universidade de São Paulo (USP). Bauru , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia molecular Genética médica DNA Saliva Análise de sequência de DNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Dna | saliva | Sequenciamento Genético | Biologia Molecular

Resumo

Para se chegar à fase de sequenciamento genético, é necessário que o DNA tenha sido devidamente processado. O primeiro passo é escolher o material de partida para coletar o material genético, ou seja, de que tipo de célula será extraído o DNA, neste caso utilizaremos a saliva para obtenção de células epiteliais da mucosa bucal que se desprenderam, pois a coleta da saliva é um método indolor, não-invasivo, sem risco de transmissão de doenças que não necessita de pessoal especializado para a coleta e que é bem aceito pela maioria das pessoas que participam do estudo, ao contrário do sangue, e além do mais, a saliva pode ser congelada antes da extração do DNA, enquanto que o sangue exige que a extração seja realizada logo após a coleta. A questão do congelamento da saliva é algo que será levado em consideração em nosso estudo, pois, sabemos que a saliva congelada por um pequeno período talvez traga benefícios, pois o congelamento provavelmente inativa enzimas que possam degradar o DNA, porém após um determinado tempo congelada, o material genético passa a ser degradado. Está disponível no mercado um kit comercial que especifica a preservação da saliva antes da extração e possui uma substância conservante que vai sendo liberada no tubo em que a saliva foi armazenada durante o congelamento, este estudo também tem por objetivo utilizá-lo para comprovar sua eficácia. Serão utilizados para extração de DNA vários kits e protocolos estabelecidos, com o objetivo de avaliar a efetividade dos mesmos quanto a quantidade e qualidade de DNA obtido. Assim, o objetivo geral deste projeto de pesquisa é avaliar a qualidade e quantidade de DNA genômico extraído a partir de saliva total com finalidade de sequenciamento direto, enquanto que os objetivos específicos são verificar se diferentes períodos de armazenamento interferem na quantidade e qualidade de DNA de partida com finalidade de sequenciamento direto para investigação de mutações. Além disso, verificar se diferentes protocolos de extração de DNA podem influenciar nestes mesmos fatores, levando-se em conta os diferentes períodos de armazenamento da saliva por congelamento.(AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

THAIS FRANCINI GARBIERI; DANIEL THOMAS BROZOSKI; THIAGO JOSÉ DIONÍSIO; CARLOS FERREIRA SANTOS; LUCIMARA TEIXEIRA DAS NEVES. Human DNA extraction from whole saliva that was fresh or stored for 3, 6 or 12 months using five different protocols. Journal of Applied Oral Science, v. 25, n. 2, p. 147-158, 2017-04-00. (09/53848-1, 11/22434-7)