Visualização Exploratória de Espaços de Características para Apoiar a Classificação Taxonômica de Algas Verdes

• Processo: 12/00269-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2012
• Data de Término da vigência: 16 de fevereiro de 2016
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Metodologia e Técnicas da Computação
• Pesquisador responsável: Maria Cristina Ferreira de Oliveira
• Beneficiário: Vinícius Ruela Pereira Borges
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação (ICMC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 13/26647-0 - Visualização exploratória para apoiar a classificação taxonômica de algas verdes, BE.EP.DR
• Assunto(s): Extração de características
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Algas verdes | Classificação visual | Extração de características | Projeção de dados multidimensionais | Visualização Computacional

Resumo

Este projeto de doutorado objetiva empregar técnicas de Visualização de Informação e Visualização Multidimensional para apoiar aclassificação taxonômica de microalgas verdes de água doce. Tais organismos possuem uma taxonomia problemática devido àsvariações nas características de uma mesma espécie que também são associadas a outras espécies de algas, introduzindo erros naclassificação manual realizada por especialistas. Espera-se que o emprego de técnicas adequadas de visualização de dadosmultidimensionais colabore para melhorar a qualidade deste processo, minimizando estes problemas e oferecendo uma alternativaconcreta à classificação manual. Entre as características utilizadas para a classificação estão descritores de forma extraídosmanualmente de imagens de algas observadas em microscópio. Com o mesmo objetivo de tornar o processo mais rápido, confiável erobusto, pretende-se também investigar, propor e implementar métodos de extração automáticas de características baseadas em formadas imagens de algas. As soluções desenvolvidas serão inicialmente avaliadas comparando-se os resultados de classificação obtidos pormeio dos métodos desenvolvidos com os resultados obtidos pelo processo convencional, fornecidos pelo biólogo especialista,colaborador deste projeto.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

BORGES, VINICIUS R. P.; DE OLIVEIRA, MARIA CRISTINA F.; SILVA, THAIS GARCIA; HENRIQUES VIEIRA, ARMANDO AUGUSTO; HAMANN, BERND. Region Growing for Segmenting Green Microalgae Images. IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, v. 15, n. 1, p. 257-270, JAN-FEB 2018. (11/22749-8, 13/26647-0, 12/00269-7)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

BORGES, Vinícius Ruela Pereira. Uma abordagem computacional para apoiar a classificação taxonômica de imagens de microalgas verdes de água doce. 2016. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação (ICMC/SB) São Carlos.