Importância de transferência genética horizontal em procariontes

• Processo: 12/50415-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2012
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2015
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Carlos Frederico Martins Menck
• Beneficiário: Huma Asif
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Reparo do DNA Filogenia Evolução
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Dna Damages | Dna Repair | Evolution | Horizontal Gene Transfer | Phylogeny | Transport Genes

Resumo

A transferência horizontal de genes (HGT - Horizontal gene transfer) é considerada uma força inovadora na geração e evolução de espécies. Quase todas as categorias de genes funcionais estão propensos à HGT, até mesmo o operon do rRNA. Entretanto, nem todos os genes são detectados como transferidos na mesma freqüência. Alguns têm claramente uma tendência maior de transferência do que outros. Acredita-se que genes operacionais (ou constitutivos) são transferidos horizontalmente com mais freqüência do que genes informacionais (aqueles envolvidos na transcrição, tradução e processos relacionados). Este projeto pretende realizar uma análise detalhada da base de dados de HGT previamente geradas em nosso laboratório. Os genes e as vias metabólicas observadas nesta base de dados serão analisadas individualmente para verificar se a abordagem in silico em larga-escala não apresenta algum artefato, e aqueles que forem mais interessantes serão incluídos nas análises da composição do domínio de certas proteínas. Os filos bacterianos com máximo HGT serão pré-selecionados. Os genes que são transferidos verticalmente e aqueles com pouca evidência para a classificação serão excluídos. No laboratório investigações prévias de diferentes categorias de genes funcionais dos candidatos HGT têm mostrado que as categorias de restrição/modificação do DNA, proteínas de transporte e ligação; elementos genéticos móveis, abrigam a maioria dos casos de HGT. Neste trabalho, planejamos explorar categorias (particularmente categorias de proteínas de transporte e ligação) dentro da perspectiva de evolução. Com isso, esperamos dar uma maior contribuição na relevância de HGT na evolução procariótica. (AU)