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Evolução genômica de grandes vírus de DNA de insetos

Processo: 13/15144-8
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 10 de outubro de 2013
Vigência (Término): 09 de outubro de 2014
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Paolo Marinho de Andrade Zanotto
Beneficiário:Atila Iamarino
Supervisor no Exterior: Jeffrey Townsend
Instituição-sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Local de pesquisa : Yale University, Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:12/04818-5 - Evolução e filodinâmica dos recombinantes BF de HIV-1 da América do Sul, BP.PD
Assunto(s):Filogenia   Evolução molecular

Resumo

Grandes vírus de DNA evoluem por recombinação e por uma sucessão de eventos de ganho e perda gênico, principalmente vindos do genoma de hospedeiros celulares. Processos que os permitem mudanças adaptativas necessárias. Como consequência, seus genomas são compostos de um núcleo replicativo que retém suas relações evolutivas, cercado por genes satélites posteriormente acrescentados, que codificam principalmente funções de interação com o hospedeiro. Este trabalho propõe comparar os genomas de grandes vírus de DNA que infectam insetos, os entomopoxvírus, iridovírus, ascovírus, baculovírus e nudivírus; e buscar a convergência de eventos independentes e paralelos de aquisição gênica que podem informar sobre a interação com o hospedeiro. Estes genes serão comparados em busca de relações evolutivas, fluxo gênico, origem, diversificação, interações epistáticas e pressão seletiva após transferência horizontal. Ao fazer isso, será possível inferir uma rede genômica que reconstrua eventos de aquisição e modificação de genes que pode demonstrar como organismos variam em complexidade ao longo do tempo. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ZHAO, ZI-MING; ZHAO, BIXIAO; BAI, YALAI; IAMARINO, ATILA; GAFFNEY, STEPHEN G.; SCHLESSINGER, JOSEPH; LIFTON, RICHARD P.; RIMM, DAVID L.; TOWNSEND, JEFFREY P. Early and multiple origins of metastatic lineages within primary tumors. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, v. 113, n. 8, p. 2140-2145, FEB 23 2016. Citações Web of Science: 45.
FREIRE, CAIO C. M.; IAMARINO, ATILA; LY SOUMARE, PEINDA O.; FAYE, OUSMANE; SALL, AMADOU A.; ZANOTTO, PAOLO M. A. Reassortment and distinct evolutionary dynamics of Rift Valley Fever virus genomic segments. SCIENTIFIC REPORTS, v. 5, JUN 23 2015. Citações Web of Science: 9.

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