Caracterização biológica de recombinantes naturais e artificiais entre os subtipos B e F de HIV-1

Resumo

Apesar dos esforços para controlar a propagação da epidemia de HIV, a grande diversidade de formas recombinantes pode estar associada ao aumento de pessoas infectadas em todo o mundo. No Brasil, muitos vírus recombinantes foram detectados. Até o momento, 5 formas recombinantes circulantes (CRF) já foram descritas (CRF28_BF, CRF29_BF, CRF39_BF, CRF40_BF, CRF46_BF). Este fato indica a relevância de formas recombinantes na epidemia brasileira. Apesar da sua crescente importância epidemiológica, pouco se sabe sobre o tropismo celular, resistência às drogas antiretrovirais, capacidade de replicação e sobre a transmissão do vírus recombinantes em nossas epidemias. Este projeto visa estudar alguns aspectos relevantes da biologia de formas recombinantes do HIV-1 circulantes no Estado de São Paulo que foram coletadas durante a Rede de Diversidade Genética Viral (VGDN), programa financiado pela FAPESP. Inicialmente, vamos procurar isolar através de co-cultivo alguns exemplares de CRF28_BF e CRF29_BF e alguns formas recombinantes adicionais. A fim de confirmar o perfil de recombinação e assinaturas genéticas particulares, o genoma de cada isolado será seqüenciado. Depois disso, o uso de co-receptores de cada isolado será determinado usando métodos de genotipagem e fenotipagem. Da mesma forma, os perfis de resistência das transcriptases reversas e proteases virais serão determinados por métodos de genotipagem e fenotipagem. Além disso, algumas proteases resistentes selecionadas serão reconstruídas in silico para simulações da interação com o inibidor Nefinavir por meio de dinâmica molecular. Além disso, algumas destas proteases selecionadas serão fenotipadas por meio de sua inserção e expressão em HIV recombinantes gerados em nosso laboratório durante experimentos de infecção celular. (AU)