Análise e caracterização molecular, estrutural e populacional de proteases de HIV-1 do estado de São Paulo

Resumo

Apesar dos esforços mundiais para o controle da infecção por HIV-1, a extrema variedade de formas recombinantes tem contribuído para o aumento no número de pacientes contaminados em todo o mundo. No Brasil inúmeros recombinantes também têm sido descritos, principalmente entre os subtipos B/F, B/C e F/D. Durante a tarefa coordenada de HIV-1 da Rede de Diversidade Genética Viral (VGDN), também foi encontrado um grande número de vírus recombinantes (B/F, B/D, B/A). A grande maioria dos vírus recombinantes BF encontrados pelo projeto VGDN possui uma protease predominantemente F. Dados estruturais sobre proteases F apontam que polimorfismos característicos do subtipo F podem atuar como mutações restauradoras da atividade enzimática de proteases resistentes a inibidores. Este estudo visa modelar e simular in silico a interação entre proteases B e F portadoras de mutações primárias de resistência similares com o inibidor Nelfinavir, amplamente utilizado no estado de São Paulo. Com base nos resultados das simulações serão induzidas as mutações mais relevantes em proteases não resistentes do subtipo B e F para medir a atividade enzimática na presença do inibidor Nelfinavir, permitindo assim inferir a influência dos polimorfismos do subtipo F na atividade de proteases resistentes. (AU)