Evolução genômica de grandes vírus de DNA de insetos

• Processo: 13/15144-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 10 de outubro de 2013
• Data de Término da vigência: 09 de outubro de 2014
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Paolo Marinho de Andrade Zanotto
• Beneficiário: Atila Iamarino
• Supervisor: Jeffrey Townsend
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Yale University, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 12/04818-5 - Evolução e filodinâmica dos recombinantes BF de HIV-1 da América do Sul, BP.PD
• Assunto(s): Filogenia Evolução molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Evolução genômica | evolução molecular | Filogenia | Recombinação | transferência horizontal | Evolução genômica

Resumo

Grandes vírus de DNA evoluem por recombinação e por uma sucessão de eventos de ganho e perda gênico, principalmente vindos do genoma de hospedeiros celulares. Processos que os permitem mudanças adaptativas necessárias. Como consequência, seus genomas são compostos de um núcleo replicativo que retém suas relações evolutivas, cercado por genes satélites posteriormente acrescentados, que codificam principalmente funções de interação com o hospedeiro. Este trabalho propõe comparar os genomas de grandes vírus de DNA que infectam insetos, os entomopoxvírus, iridovírus, ascovírus, baculovírus e nudivírus; e buscar a convergência de eventos independentes e paralelos de aquisição gênica que podem informar sobre a interação com o hospedeiro. Estes genes serão comparados em busca de relações evolutivas, fluxo gênico, origem, diversificação, interações epistáticas e pressão seletiva após transferência horizontal. Ao fazer isso, será possível inferir uma rede genômica que reconstrua eventos de aquisição e modificação de genes que pode demonstrar como organismos variam em complexidade ao longo do tempo. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

FREIRE, CAIO C. M.; IAMARINO, ATILA; LY SOUMARE, PEINDA O.; FAYE, OUSMANE; SALL, AMADOU A.; ZANOTTO, PAOLO M. A.. Reassortment and distinct evolutionary dynamics of Rift Valley Fever virus genomic segments. SCIENTIFIC REPORTS, v. 5, JUN 23 2015. (10/19341-4, 12/04818-5, 13/15144-8, 14/06090-4)

ZHAO, ZI-MING; ZHAO, BIXIAO; BAI, YALAI; IAMARINO, ATILA; GAFFNEY, STEPHEN G.; SCHLESSINGER, JOSEPH; LIFTON, RICHARD P.; RIMM, DAVID L.; TOWNSEND, JEFFREY P.. Early and multiple origins of metastatic lineages within primary tumors. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, v. 113, n. 8, p. 6-pg., 2016-02-23. (13/15144-8, 12/04818-5)

ZHAO, ZI-MING; ZHAO, BIXIAO; BAI, YALAI; IAMARINO, ATILA; GAFFNEY, STEPHEN G.; SCHLESSINGER, JOSEPH; LIFTON, RICHARD P.; RIMM, DAVID L.; TOWNSEND, JEFFREY P.. Early and multiple origins of metastatic lineages within primary tumors. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, v. 113, n. 8, p. 2140-2145, FEB 23 2016. (12/04818-5, 13/15144-8)