Identificação de RNAs não codificantes e avaliação de seu envolvimento na patogenicidade do dermatófito Trichophyton rubrum

• Processo: 12/22232-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2013
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2013
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Nilce Maria Martinez-Rossi
• Beneficiário: Gabriela Felix Persinoti
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 13/19195-6 - Análise do transcriptoma de Trichophyton rubrum: estrutura, expressão e regulação gênica envolvidas com a patogenicidade, BE.EP.PD
• Assunto(s): RNAs não codificadores Biologia computacional Virulência Trichophyton rubrum
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Patogenicidade | RNAs não codificadores | Trichophyton rubrum | Bioinformática

Resumo

Nas últimas décadas a incidência de infecções fúngicas tem aumentado cada vez mais, devido principalmente ao aumento do número de indivíduos imunocompromentidos, sendo que as dermatofitoses constituem uma das infecções fúngicas mais frequentes, acometendo tanto indivíduos hígidos quanto imunocomprometidos. O dermatófito Trichophyton rubrum é o isolado clínico mais frequente em casos de infecções de pele e unha em humanos. Apesar da importância clínica de T. rurbum principalmente por sua alta incidência, pouco se sabe sobre a patogênese destas infecções. O sequenciamento do genoma deste e de outros dermatófitos revelou uma alta similaridade entre esses organismos com um pequeno número de genes específicos de cada uma das espécies, porém cada uma destas é adaptada a um hospedeiro específico. Esta especificidade de nichos pode estar relacionada com a diferente regulação da expressão gênica de fatores de virulência entre as diferentes espécies, a qual pode ser desempenhada por RNAs não codificadores (ncRNAs). Estes RNAs não codificam proteínas, porém cada vez mais se evidencia que estas moléculas participam na regulação de processos importantes na célula. A proposta do presente trabalho é identificar e anotar ncRNAs no genoma de T. rubrum e dos demais dermatófitos, buscando verificar se os mecanismos moleculares envolvidos na patogenicidade e especificidade de nicho da espécie antropofílica T. rubrum, seriam regulados por ncRNAs. Além da análise dos ncRNAs, o trabalho propõe mapear os sítios de início de transcrição dos genes de T. rubrum.Os resultados a serem obtidos irão contribuir com o entendimento da regulação da expressão gênica neste organismo, podendo revelar mecanismos ainda não conhecidos de regulação gênica de fatores de virulência, novos elementos gênicos, bem como aumentar a precisão da anotação atualmente disponível. Estas informações contribuem com o entendimento da fisio-patologia das dermatofitoses e podem, indiretamente, contribuir para o desenvolvimento de novas estratégias terapêuticas, ou revelar novos alvos moleculares para o desenvolvimento de novas drogas antifúngicas.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

PERSINOTI, GABRIELA F.; MARTINEZ, DIEGO A.; LI, WENJUN; DOGEN, AYLIN; BILLMYRE, R. BLAKE; AVERETTE, ANNA; GOLDBERG, JONATHAN M.; SHEA, TERRANCE; YOUNG, SARAH; ZENG, QIANDONG; et al. Whole-Genome Analysis Illustrates Global Clonal Population Structure of the Ubiquitous Dermatophyte Pathogen Trichophyton rubrum. Genetics, v. 208, n. 4, p. 1657-1669, APR 2018. (13/19195-6, 12/22232-8)